New Reagents for Quantifying the Routing and Kinetics of T-cell Activation

Informazioni relative al progetto

KineTic

ID dell’accordo di sovvenzione: 865175

DOI

10.3030/865175

Data della firma CE 12 Febbraio 2020

Data di avvio 1 Agosto 2020

Data di completamento 31 Gennaio 2026

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 2 000 000,00

Contributo UE

€ 2 000 000,00

Coordinato da

UNIVERSITEIT LEIDEN
Netherlands

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Pubblicazioni

Peer reviewed articles (12)

QUAS-R: An SLC1A5-mediated glutamine uptake assay with single-cell resolution reveals metabolic heterogeneity with immune populations

Autori: Leonard R. Pelgrom, Gavin M. Davis, Simon O’Shaughnessy, Emilie J.M. Wezenberg, Sander I. Van Kasteren, David K. Finlay, Linda V. Sinclair
Pubblicato in: Cell Reports, Numero 42, 2024, Pagina/e 112828, ISSN 2211-1247
Editore: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2023.112828

Single-cell analysis of regions of interest (SCARI) using a photosensitive tag

Autori: Anne M. van der Leun, Mirjam E. Hoekstra, Luuk Reinalda, Colinda L. G. J. Scheele, Mireille Toebes, Michel J. van de Graaff, Linda Y. Y. Chen, Hanjie Li, Akhiad Bercovich, Yaniv Lubling, Eyal David, Daniela S. Thommen, Amos Tanay, Jacco van Rheenen, Ido Amit, Sander I. van Kasteren & Ton N. Schumacher
Pubblicato in: Nature Chemical biology, Numero 17, 2021, Pagina/e 1139-1147, ISSN 1552-4450
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00839-x

Citrullinated human and murine MOG35-55 display distinct biophysical and biochemical behavior

Autori: W. Doelman, R.C. Reijnen, N. Dijksman, A.P.A. Janssen, N. van Driel, B.A. ’t Hart, I. Philippens, C. Araman, W. Baron, S.I. van Kasteren
Pubblicato in: Journal of Biological Chemistry, 2023, ISSN 1083-351X
Editore: Elsevier Inc on behalf of American Society for Biochemistry and Molecular Biology
DOI: 10.1016/j.jbc.2023.103065

Bioorthogonal Correlative Light-Electron Microscopy of Mycobacterium tuberculosis in Macrophages Reveals the Effect of Antituberculosis Drugs on Subcellular Bacterial Distribution

Autori: Thomas Bakkum, Matthias T. Heemskerk, Erik Bos, Mirjam Groenewold, Nikolaos Oikonomeas-Koppasis, Kimberley V. Walburg, Suzanne van Veen, Martijn J. C. van der Lienden, Tyrza van Leeuwen, Marielle C. Haks, Tom H. M. Ottenhoff, Abraham J. Koster, and Sander I. van Kasteren
Pubblicato in: ACS Central Science, Numero 6,11, 2020, Pagina/e 1997–2007, ISSN 2374-7943
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acscentsci.0c00539

A Lysosome-Targeted Tetrazine for Organelle-Specific Click-to-Release Chemistry in Antigen Presenting Cells

Autori: Nina A.M. Ligthart, Mark A.R. de Geus, Merel A.T. van de Plassche, Diana Torres García, Marjolein M.E. Isendoorn, Luuk Reinalda, Daniëlle Ofman, Tyrza van Leeuwen, Sander I. van Kasteren
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 145, 2023, Pagina/e 12630-12640, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.3c02139

Probing the metalloproteome: an 8-mercaptoquinoline motif enriches minichromosome maintenance complex components as significant metalloprotein targets in live cells

Autori: Sean M. McKenna, Bogdan I. Florea, Daniela M. Zisterer, Sander I. van Kasteren, Joanna F. McGouran
Pubblicato in: RSC Chemical Biology, Numero 5, 2024, Pagina/e 776-786, ISSN 2633-0679
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d4cb00053f

Live-cell imaging of sterculic acid - a naturally occurring 1,2-cyclopropene fatty acid - by bioorthogonal reaction with turn-on tetrazine-fluorophore conjugates

Autori: Kristine Bertheussen; Merel van de Plassche; Thomas Bakkum; Berend Gagestein; Iakovia Ttofi; Alexi J. C. Sarris; Herman S. Overkleeft; Mario van der Stelt; Sander I. van Kasteren
Pubblicato in: Angewandte Chemie (International Edition), Numero 1, 2022, ISSN 1433-7851
Editore: John Wiley & Sons Ltd.

Application of a Highly Selective Cathepsin S Two-step Activity-Based Probe in Multicolor Bio-Orthogonal Correlative Light-Electron Microscopy

Autori: Floris J. van Dalen; Thomas Bakkum; Tyrza van Leeuwen; Mirjam Groenewold; Edgar Deu; Abraham J. Koster; Sander I. van Kasteren; Martijn Verdoes
Pubblicato in: Frontiers in Chemistry, Numero 1, 2021, Pagina/e 628433, ISSN 2296-2646
Editore: Frontiers
DOI: 10.3389/fchem.2020.628433

Bioorthogonal Peptide Enrichment From Complex Samples Using a Rink-Amide-Based Catch-and-Release Strategy

Autori: Tyrza van Leeuwen, Ward Doelman, Robin W.R. van den Kieboom, Bogdan I. Florea, Sander I. van Kasteren
Pubblicato in: ChemBioChem, Numero e202300082, 2023, ISSN 1439-4227
Editore: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/cbic.202300082

Methyltetrazine as a small live-cell compatible bioorthogonal handle for imaging enzyme activities in situ

Autori: Diana Torres-García; Merel A. T. van de Plassche; Emma van Boven; Tyrza van Leeuwen; Mirjam G. J. Groenewold; Alexi J. C. Sarris; Luuk Klein; Herman S. Overkleeft; Sander I. van Kasteren
Pubblicato in: RSC Chemical Biology, Numero 1, 2022, Pagina/e 1325-1330, ISSN 2633-0679
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d2cb00120a

Single-molecule imaging of glycan–lectin interactions on cells with Glyco-PAINT

Autori: Roger Riera, Tim P. Hogervorst, Ward Doelman, Yan Ni, Silvia Pujals, Evangelia Bolli, Jeroen D. C. Codée, Sander I. van Kasteren & Lorenzo Albertazzi
Pubblicato in: Nature Chemical Biology, Numero 17, 2021, Pagina/e 1281-1288, ISSN 1552-4450
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41589-021-00896-2

Bioorthogonal protein labelling enables the study of antigen processing of citrullinated and carbamylated auto-antigens

Autori: Tyrza van Leeuwen; Can Araman; Linda Pieper Pournara; Arieke S. B. Kampstra; Thomas Bakkum; Mikkel H. S. Marqvorsen; Clarissa R. Nascimento; G. J. Mirjam Groenewold; Willemijn van der Wulp; Marcel Camps; George M.C. Janssen; Peter A. van Veelen; Gerard J. P. van Westen; Antonius P A Janssen; Bogdan I. Florea; Herman S. Overkleeft; Ferry Ossendorp; René E. M. Toes; Sander I. van Kasteren
Pubblicato in: RSC Chemical Biology, Numero 2, 2021, Pagina/e 855-862, ISSN 2633-0679
Editore: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d1cb00009h