Projektbeschreibung
Empfindliche Erkennung von Krebs- und Virus-Biomarkern in Flüssigbiopsien
Die Erkennung von zirkulierenden Krankheitsbiomarkern in Körperflüssigkeiten bietet ein beachtliches diagnostisches Potenzial. Doch noch kann dieses Potenzial aufgrund der mangelnden Empfindlichkeit und des hohen Kostenaufwands nicht voll ausgeschöpft werden. Das Wissenschaftlerteam des EU-finanzierten Projekts ANFIBIO wird mithilfe von ad-hoc synthetisierten Goldnanosternen die Amplifizierbarkeit der oberflächenverstärkten Ramanstreuung (SERS) verbessern – ein Verfahren, das zur Erkennung einzelner Moleküle eingesetzt wird. Das Projekt wird sich auf die Erkennung und Quantifizierung von Prostatakarzinom-DNA und Influenza-A-Virus-DNA in Blut, Urin und Speichel konzentrieren und die Konzentrationen mit denen in Gewebe und Zellen vergleichen. Die endgültig ausgefeilte Technologie wird nur noch eine minimale Probenvorbehandlung benötigen und ohne Zielamplifizierung auskommen und damit die Erkennung von Biomarkern in Flüssigbiopsien um ein Vielfaches erleichtern.
Ziel
The detection of circulating disease biomarkers in bodily fluids, also known as liquid biopsy, has taken important strides toward the implementation of personalized medicine. However, it still suffers from low sensitivity and high costs, which render its clinical implementation not practical or affordable. In particular, the identification and quantification of oligonucleotide biomarkers is hampered by the need to employ long- and short-read sequencing tools that are expensive, require highly trained personnel, and are prone to error. Nonetheless, the recent clinical breakthroughs demonstrating the importance of detecting cancerous or viral biomarker to susceptibility, onset, and aggressiveness of the disease, motivate the need for further research that could render their detection simpler, cheaper, and thus more widely available.
By leveraging the intrinsic amplification capability of surface enhanced Raman scattering (SERS), in ANFIBIO I will address the issues of low sensitivity and high costs by combining plasmonic nanoparticles synthesized ad hoc to maximize SERS signal amplification with direct SERS sensing and machine learning tools for the rapid analysis of the complex spectral responses obtained by screening bodily fluids for specific target biomarkers. I will focus in particular on prostate cancer (PCa) DNA and influenza A viral (IAV) RNA in blood, urine, and saliva, to quantify and correlate their amounts to those detected in tissues and cells.
At completion, the proposed work will deliver a breakthrough sensing technology capable of detecting and quantifying cancerous and viral biomarkers in bodily fluids, with minimal sample pretreatment, no target amplification, and that uses SERS as novel and reliable transduction mechanism with distinct advantages over those currently employed. Furthermore, the fundamental insight garnered will likely assess the feasibility of using direct SERS sensing to develop beyond-third generation sequencing technologies.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Gesundheitswissenschaften Infektionskrankheit RNS-Virus Grippe
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Onkologie
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- Technik und Technologie Nanotechnologie Nanomaterialien
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
ERC-COG - Consolidator Grant
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2019-COG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
10129 Torino
Italien
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.