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Resultado final
A data set containing spatial coordinates of germ and somatic cells
3D gonad cell maps (se abrirá en una nueva ventana)A 3D spatial map of gonadal cells in male and female human embryos
2D ST gonad data set (se abrirá en una nueva ventana)A data set containing gene expression matrices linked to their spatial positions within Hematoxylin and Eosin HE stained developmental gonad tissue sections
2D ISS gonad data set (se abrirá en una nueva ventana)A data set containing gene expression images in human developmental gonad tissue sections
3D integrated image data (se abrirá en una nueva ventana)3D image datasets integrated in 3D models of whole developmental gonads
2D gonad cell map (se abrirá en una nueva ventana)A 2D ultrahigh content cellular and protein expression map of gonadal cells in male and female human embryos
Imaging mass cytometry analysis of developing gonads (se abrirá en una nueva ventana)Imaging mass data of human gonads during sex determination
3D integrated spatial OMICS data (se abrirá en una nueva ventana)Spatial OMICS data sets integrated in 3D models of whole developmental gonads
ISS profiling in cleared tissues (se abrirá en una nueva ventana)Protocols for generating spatial ISS expression data in optically cleared tissues
Integration of spatial and scRNA/scATAC-seq data (se abrirá en una nueva ventana)Computational integration of spatial and scRNAATACseq datasets
ST profiling in cleared tissues (se abrirá en una nueva ventana)Protocols for generating ST expression data in optically cleared tissues
A centralized web-resource to provide access to multi-omics data from the HUGODECA project
This deliverable is composed of: the web site, the graphic charter, the project leaflet.
Final public symposium on sex determination differences, human reproduction and gender (se abrirá en una nueva ventana)Training courses on Spatial transcriptomics and 3D imaging/tissue clearing (se abrirá en una nueva ventana)
Publicaciones
Autores:
Malene Lundgaard Riis, Anne Jørgensen
Publicado en:
Frontiers in Cell and Developmental Biology, Edición 2296634x, 2022, ISSN 2296-634x
Editor:
Frontiers in Cell and Developmental Biology
DOI:
10.3389/fcell.2022.902082
Autores:
Luz Garcia-Alonso, Valentina Lorenzi, Cecilia Icoresi Mazzeo, João Pedro Alves-Lopes, Kenny Roberts, Carmen Sancho-Serra, Justin Engelbert, Magda Marečková, Wolfram H Gruhn, Rachel A Botting, Tong Li, Berta Crespo, Stijn van Dongen , Vladimir Kiselev, Elena Prigmore, Mary Herbert, Ashley Moffett, Alain Chedotal, Omer Ali Bayraktar, Azim Surani, Muzlifah Haniffa, Roser Vento-Tormo
Publicado en:
Nature, Edición 14764687, 2022, ISSN 1476-4687
Editor:
Nature
DOI:
10.1038/s41586-022-04918-4
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