The human retina at single cell resolution: functional architecture, disease mechanism and therapy development

Informations projet

HURET

N° de convention de subvention: 883781

DOI

10.3030/883781

Projet clôturé

Date de signature de la CE 12 Mai 2020

Date de début 1 Novembre 2020

Date de fin 31 Octobre 2025

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 2 500 000,00

Contribution de l’UE

€ 2 500 000,00

Coordonné par

INSTITUT FUR MOLEKULARE UND KLINISCHE OPHTHALMOLOGIE BASEL
Switzerland

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Publications

Non-peer reviewed articles (2)

In vivo single-cell gene editing using RNA electroporation reveals sequential adaptation of cortical neurons to excitatory-inhibitory imbalance

Auteurs: Georg Kosche, Alex Fratzl, Martin Munz, Botond Roska
Publié dans: bioRxiv, 2025, ISSN 2692-8205
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory.
DOI: 10.1101/2025.09.13.672380

Cell type-focused compound screen in human organoids reveals molecules and pathways controlling cone photoreceptor death

Auteurs: Spirig SE, Arteaga-Moreta VJ, Raics Z, Posada-Céspedes S, Chreng S, Galuba O, Galuba I, Claerr I, Renner S, Kleindienst T, Volak A, Imbach J, Malysheva S, Siwicki RA, Hahaut V, Hou Y, Picelli S, Cattaneo M, Jüttner J, Cowan CS, Duckely M, Baeschlin DK, Renner M, Unterreiner V, Roska B.
Publié dans: BioRxiv, 2023, ISSN 2692-8205
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.10.09.561525

Peer reviewed articles (18)

Moculus: an immersive virtual reality system for mice incorporating stereo vision

Auteurs: Linda Judák, Gergely Dobos, Katalin Ócsai, Eszter Báthory, Huba Szebik, Balázs Tarján, Pál Maák, Zoltán Szadai, István Takács, Balázs Chiovini, Tibor Lőrincz, Áron Szepesi, Botond Roska,
Publié dans: Nature Methods, Numéro 22, 2025, Page(s) 386-398, ISSN 1548-7091
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41592-024-02554-6

Individual thalamic inhibitory interneurons are functionally specialized towards distinct visual features.

Auteurs: Muellner F, Roska B
Publié dans: Neuron, 2024, ISSN 0896-6273
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1101/2023.03.22.533751

The sodium-bicarbonate cotransporter Slc4a5 mediates feedback at the first synapse of vision

Auteurs: Rei Morikawa, Tiago M. Rodrigues, Helene Marianne Schreyer, Cameron S. Cowan, Sarah Nadeau, Alexandra Graff-Meyer, Claudia P. Patino-Alvarez, Mohammad Hossein Khani, Josephine Jüttner, Botond Roska
Publié dans: Neuron, Numéro 112, 2025, Page(s) 3715-3733.e9, ISSN 0896-6273
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2024.08.015

Whole-brain functional ultrasound imaging in awake head-fixed mice

Auteurs: Clément Brunner, Micheline Grillet, Alan Urban, Botond Roska, Gabriel Montaldo & Emilie Macé
Publié dans: Nature Protocols, 2021, ISSN 1754-2189
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41596-021-00548-8

Partial recovery of visual function in a blind patient after optogenetic therapy

Auteurs: José-Alain Sahel, Elise Boulanger-Scemama, Chloé Pagot, Angelo Arleo, Francesco Galluppi, Joseph N. Martel, Simona Degli Esposti, Alexandre Delaux, Jean-Baptiste de Saint Aubert, Caroline de Montleau, Emmanuel Gutman, Isabelle Audo, Jens Duebel, Serge Picaud, Deniz Dalkara, Laure Blouin, Magali Taiel, Botond Roska
Publié dans: Nature Medicine, 2021, ISSN 1078-8956
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-021-01351-4

Engineering infrared light detection in blind human retina using ultrasensitive human TRPV1 channels

Auteurs: Morgan Chevalier, Firas Fadel, Tímea Májer, Dániel Péter Magda, Lili Gerendás, Ferenc Kilin, Zoltán Zsolt Nagy, Arnold Szabó, Botond Roska, Guilherme Testa-Silva
Publié dans: Trends in Biotechnology, Numéro 43, 2025, Page(s) 3236-3252, ISSN 0167-7799
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.tibtech.2025.07.033

Sharp-wave ripple doublets induce complex dendritic spikes in parvalbumin interneurons in vivo

Auteurs: Linda Judák, Balázs Chiovini, Gábor Juhász, Dénes Pálfi, Zsolt Mezriczky, Zoltán Szadai, Gergely Katona, Benedek Szmola, Katalin Ócsai, Bernadett Martinecz, Anna Mihály, Ádám Dénes, Bálint Kerekes, Áron Szepesi, Gergely Szalay, István Ulbert, Zoltán Mucsi, Botond Roska & Balázs Rózsa
Publié dans: Nature Communications, 2022, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-022-34520-1

Restoring light sensitivity using tunable near-infrared sensors

Auteurs: Dasha Nelidova, Rei K Morikawa, Cameron S Cowan, Zoltan Raics, David Goldblum, Hendrik P N Scholl, Tamas Szikra, Arnold Szabo, Daniel Hillier, Botond Roska
Publié dans: Science, 2020, ISSN 0036-8075
Éditeur: American Association for the Advancement of Science
DOI: 10.1126/science.aaz5887

Individual thalamic inhibitory interneurons are functionally specialized toward distinct visual features

Auteurs: Fiona E. Müllner, Botond Roska
Publié dans: Neuron, Numéro 112, 2024, Page(s) 2765-2782.e9, ISSN 0896-6273
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2024.06.001

Synchronization of visual perception within the human fovea

Auteurs: Annalisa Bucci, Marc Büttner, Niklas Domdei, Federica B. Rosselli, Matej Znidaric, Julian Bartram, Tobias Gänswein, Roland Diggelmann, Martina De Gennaro, Cameron S. Cowan, Wolf Harmening, Andreas H
Publié dans: Nature Neuroscience, Numéro 28, 2025, Page(s) 1959-1967, ISSN 1097-6256
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-025-02011-3

Ectopic expression of a mechanosensitive channel confers spatiotemporal resolution to ultrasound stimulations of neurons for visual restoration

Auteurs: Sara Cadoni, Charlie Demené, Ignacio Alcala, Matthieu Provansal, Diep Nguyen, Dasha Nelidova, Guillaume Labernède, Jules Lubetzki, Ruben Goulet, Emma Burban, Julie Dégardin, Manuel Simonutti, Gregory Gauvain, Fabrice Arcizet, Olivier Marre, Deniz Dalkara, Botond Roska, José Alain Sahel, Mickael Tanter & Serge Picaud
Publié dans: Nat Nanotechnol., 2023, ISSN 1748-3387
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41565-023-01359-6

Pyramidal neurons form active, transient, multilayered circuits perturbed by autism-associated mutations at the inception of neocortex

Auteurs: Martin Munz, Arjun Bharioke, Georg Kosche, Verónica Moreno-Juan, Alexandra Brignall, Tiago M Rodrigues, Alexandra Graff-Meyer, Talia Ulmer, Stephanie Haeuselmann, Dinko Pavlinic, Nicole Ledergerber, Brigitte Gross-Scherf, Balázs Rózsa, Jacek Krol, Simone Picelli, Cameron S Cowan, Botond Roska
Publié dans: Cell, 2023, ISSN 1097-4172
Éditeur: Cell Press / Elsevier Inc.
DOI: 10.1016/j.cell.2023.03.025

Joint visual-vestibular computation of head direction and reflexive eye movement

Auteurs: Tamas Dalmay, Luke Ewig, Botond Roska, Rava Azeredo da Silveira
Publié dans: BioRxiv, 2025, ISSN 2692-8205
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.02.11.637650

Cell Types of the Human Retina and Its Organoids at Single-Cell Resolution

Auteurs: Cameron S Cowan, Magdalena Renner, Martina De Gennaro, Brigitte Gross-Scherf, David Goldblum, Yanyan Hou, Martin Munz, Tiago M Rodrigues, Jacek Krol, Tamas Szikra, Rachel Cuttat, Annick Waldt, Panagiotis Papasaikas, Roland Diggelmann, Claudia P Patino-Alvarez, Patricia Galliker, Stefan E Spirig, Dinko Pavlinic, Nadine Gerber-Hollbach, Sven Schuierer, Aldin Srdanovic, Marton Balogh, Riccardo Panero
Publié dans: Cell, 2020, ISSN 1097-4172
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.cell.2020.08.013

High-efficiency base editing in the retina in primates and human tissues

Auteurs: Alissa Muller, Jack Sullivan, Wibke Schwarzer, Mantian Wang, Cindy Park-Windhol, Pascal W. Hasler, Lucas Janeschitz-Kriegl, Mert Duman, Beryll Klingler, Jane Matsell, Simon Manuel Hostettler, Patricia Galliker, Yanyan Hou, Pierre Balmer, Tamás Virág, Luis Alberto Barrera, Lauren Young, Quan Xu, Dániel Péter Magda, Ferenc Kilin, Arogya Khadka, Pierre-Henri Moreau, Lyne Fellmann, Thierry Azoulay
Publié dans: Nature Medicine, Numéro 31, 2025, Page(s) 490-501, ISSN 1078-8956
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41591-024-03422-8

Roadmap for direct and indirect translation of optogenetics into discoveries and therapies for humans

Auteurs: Christian Lüscher, Valentina Emiliani, Nita Farahany, Aryn Gittis, Viviana Gradinaru, Katherine A. High, Botond Roska, José-Alain Sahel, Ofer Yizhar, Hongkui Zeng, Karl Deisseroth
Publié dans: Nature Neuroscience, Numéro 28, 2025, Page(s) 2415-2431, ISSN 1097-6256
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41593-025-02097-9

General anesthesia globally synchronizes activity selectively in layer 5 cortical pyramidal neurons

Auteurs: Arjun Bharioke, Martin Munz, Alexandra Brignall, Georg Kosche, Max Ferdinand Eizinger, Nicole Ledergerber, Daniel Hillier, Brigitte Gross-Scherf, Karl-Klaus Conzelmann, Emilie Macé, Botond Roska
Publié dans: Neuron, 2022, ISSN 0896-6273
Éditeur: Cell Press
DOI: 10.1016/j.neuron.2022.03.032

Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development

Auteurs: Philipp Wahle, Giovanna Brancati, Christoph Harmel, Zhisong He, Gabriele Gut, Jacobo Sarabia del Castillo, Aline Xavier da Silveira dos Santos, Qianhui Yu, Pascal Noser, Jonas Simon Fleck, Bruno Gjeta, Dinko Pavlinić, Simone Picelli, Max Hess, Gregor W. Schmidt, Tom T. A. Lummen, Yanyan Hou, Patricia Galliker, David Goldblum, Marton Balogh, Cameron S. Cowan, Hendrik P. N. Scholl, Botond Roska, Ma
Publié dans: Nat Biotechnol., 2023, ISSN 1087-0156
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-023-01747-2