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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Linking sequence to function of long noncoding RNAs with CRISPR.

Descripción del proyecto

Caracterización funcional de los ARN no codificantes de cadena larga

Junto con los genes que codifican las proteínas, nuestro genoma contiene genes que codifican ARN no codificantes de cadena larga (ARNncl) con una función reguladora profunda. Sin embargo, se ha caracterizado un porcentaje muy pequeño de ARNncl con respecto a su importancia biológica. La hipótesis de trabajo del proyecto CRISPR-Locate, financiado con fondos europeos, es que los ARNncl están formados por distintos dominios funcionales. Los científicos han desarrollado una técnica de alto rendimiento capaz de detectar y caracterizar por completo ARNncl en compartimentos celulares diferentes. El proyecto llevará a cabo una asociación fundamental entre las secuencias y funciones de los ARNncl con el objetivo de liberar el potencial de los genes de ARNncl en biología y medicina.

Objetivo

A great surprise in the wake of the Human Genome Project has been the discovery of vast numbers of RNAs that do not encode proteins. Alongside 19,000 protein-coding genes, our genome contains at least 20,000 long noncoding RNA (lncRNA) genes, but recent estimates push that number to 100,000. Extensive annotation efforts are presently discovering lncRNAs far faster than their functions can be elucidated, and thus only <1% of lncRNAs have been experimentally characterised. These discoveries have created a grand challenge of understanding lncRNAs’ biological significance. To do this, we must solve the pressing question of how lncRNAs’ functions are encoded in their primary sequence. As a proxy of lncRNAs function we can use subcellular localisation since lncRNAs function as a mature RNA molecule. One hypothesis is that, similar to proteins, lncRNAs are modular molecules composed of separable functional domains. Previous studies, including my own, have used conventional methods to identify domains in a handful of lncRNAs by laborious deletion experiments. I propose to advance this field, via a novel high-throughput technique, CRISPR-Locate, capable of detecting lncRNA domains and their function in their natural endogenous context. I will delete ⁓1000 different lncRNA domains at the same time and simultaneously insert RNA tags at their place. Subsequently, I will fractionate cells by their compartments and purify tagged lncRNAs. Afterwards, I will sequence all the tagged lncRNAs and, by comparing the change in the subcellular localisation between mutated and wild type cells, I will identify which domains are responsible for subcellular localization. Finally, I will use CRISPR-Locate to create a map of lncRNA domains, an invaluable resource linking sequence to function, and bring us a step closer to unlocking the potential of 10^4 novel genes in medicine and biology.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2019

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

UNIVERSITY COLLEGE DUBLIN, NATIONAL UNIVERSITY OF IRELAND, DUBLIN
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 184 590,72
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 184 590,72

Participantes (1)

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