Opis projektu
Charakteryzacja funkcji długich niekodujących RNA
Oprócz genów kodujących białka nasz genom zawiera geny kodujące długie niekodujące RNA (lncRNA) pełniące ważne funkcje regulacyjne. Jednak do tej pory scharakteryzowano biologiczne znaczenie jedynie niewielkiego procenta lncRNA. Proponowana przez naukowców z finansowanego przez UE projektu CRISPR-Locate hipoteza zakłada, że lncRNA składa się z różnych domen funkcjonalnych. Badacze opracowali wysokowydajną technikę zdolną do wykrywania i pełnego scharakteryzowania lncRNA w obrębie różnych przedziałów komórkowych. Powiążą oni sekwencje i funkcje lncRNA, aby umożliwić wykorzystywanie potencjału genów lncRNA w biologii i medycynie.
Cel
A great surprise in the wake of the Human Genome Project has been the discovery of vast numbers of RNAs that do not encode proteins. Alongside 19,000 protein-coding genes, our genome contains at least 20,000 long noncoding RNA (lncRNA) genes, but recent estimates push that number to 100,000. Extensive annotation efforts are presently discovering lncRNAs far faster than their functions can be elucidated, and thus only <1% of lncRNAs have been experimentally characterised. These discoveries have created a grand challenge of understanding lncRNAs’ biological significance. To do this, we must solve the pressing question of how lncRNAs’ functions are encoded in their primary sequence. As a proxy of lncRNAs function we can use subcellular localisation since lncRNAs function as a mature RNA molecule. One hypothesis is that, similar to proteins, lncRNAs are modular molecules composed of separable functional domains. Previous studies, including my own, have used conventional methods to identify domains in a handful of lncRNAs by laborious deletion experiments. I propose to advance this field, via a novel high-throughput technique, CRISPR-Locate, capable of detecting lncRNA domains and their function in their natural endogenous context. I will delete ⁓1000 different lncRNA domains at the same time and simultaneously insert RNA tags at their place. Subsequently, I will fractionate cells by their compartments and purify tagged lncRNAs. Afterwards, I will sequence all the tagged lncRNAs and, by comparing the change in the subcellular localisation between mutated and wild type cells, I will identify which domains are responsible for subcellular localization. Finally, I will use CRISPR-Locate to create a map of lncRNA domains, an invaluable resource linking sequence to function, and bring us a step closer to unlocking the potential of 10^4 novel genes in medicine and biology.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka RNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Przepraszamy… podczas wykonywania operacji wystąpił nieoczekiwany błąd.
Wymagane uwierzytelnienie. Powodem może być wygaśnięcie sesji.
Dziękujemy za przesłanie opinii. Wkrótce otrzymasz wiadomość e-mail z potwierdzeniem zgłoszenia. W przypadku wybrania opcji otrzymywania powiadomień o statusie zgłoszenia, skontaktujemy się również gdy status ulegnie zmianie.
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) H2020-MSCA-IF-2019
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
4 DUBLIN
Irlandia
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.