Description du projet
Imagerie en temps réel des quadruplexes G d’ADN
Les séquences ADN riches en nucléotides guanine forment des structures tétramériques connues sous le nom de quadruplexes G, qui ont des rôles biologiques potentiels dans le fonctionnement, l’organisation, la réplication et la transcription des télomères. Cependant, nous manquons d’outils pour visualiser directement les quadruplexes G dans les cellules vivantes. Pour répondre à cela, le projet PLIM-G4, financé par l’UE, propose de développer des sondes optiques qui vont interagir avec différentes topologies de l’ADN et ainsi, leur temps d’émission sera fonction de la topologie. L’optimisation des propriétés de ces sondes rendra possible l’imagerie en temps réel des quadruplexes G dans les cellules vivantes, ce qui permettra de dévoiler de nouvelles informations sur le rôle et la dynamique des quadruplexes G dans les processus biologiques.
Objectif
There has been increasing experimental evidence suggesting that tetra-stranded DNA structures (G-quadruplexes) play important biological roles in telomere function and maintenance, replication and transcription. The most direct evidence for their existence has come from immuno-staining in fixed cells as well as from recent deep sequencing studies. However, to date, we are still lacking tools that allows us to visualizing G-quadruplexes directly in live cells. While several small-molecule probes that fluoresce upon interaction with DNA have been reported, none of them have been successful at imaging G-quadruplexes in a cellular environment. This is mainly due to the fact that they rely on changes in intensity which are not possible to track properly in a cellular environment. Recently, the host lab reported a novel strategy to image G-quadruplexes in live cells. This approach makes use of the changes in emission lifetime (rather than intensity) of optical probes upon their interaction with different topologies of DNA. Since life-time is concentration independent, this approach can be successfully used to image G-quadruplexes in live cells. While this has proven to be a highly successful approach, it is still in its infancy since the probe developed so far has a number of limitations such as low brightness, relatively small lifetime range and low selectivity. Thus, this project aims to develop a new set of probes that address all these issues and use them to image the dynamics of G-quadruplexes in live cells in real time. I propose to develop platinum complexes (which 'switch-on' their phosphorescent upon interactions with DNA) with high affinity and selectivity for G-quadruplexes. To achieve this, novel approaches for automated synthesis and high-throughput analysis will be developed. The new probes will be used to carry out Phosphorescence Lifetime Imaging Microscopy (PLIM) studies to give evidence for the first time of the dynamics of G-quadruplexes in live cells.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences chimiques chimie inorganique métal de transition
- sciences naturelles mathématiques mathématiques pures topologie
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
-
H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
SW7 2AZ London
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.