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microRNA assay system based on self-assembled nanoscale DNA origami arrays

Description du projet

Nouveau système de dosage des microARN

Les microARN (miARN) constituent des biomarqueurs potentiels pour le diagnostic, le pronostic et le traitement du cancer. La quantification des miARN est importante pour la détection précoce du cancer et le suivi de sa progression. Les techniques actuelles de détection des miARN basées sur l’amplification de l’ADN sont chronophages, présentent une faible capacité de multiplexage et ne permettent pas une quantification absolue. Le projet miRanDa, financé par l’UE, propose de développer un système de dosage des miARN basé sur des matrices d’origami d’ADN à l’échelle nanométrique auto-assemblées pour la détection simultanée de plusieurs cibles de miARN dans les cellules et le plasma du cancer du sein en utilisant une technique de super-résolution: l’accumulation de points pour l’imagerie en topographie nanométrique, appelée DNA-PAINT. Ce test peut être développé et adapté à la détection rapide, spécifique, sensible et multiple d’autres espèces d’acides nucléiques.

Objectif

MicroRNAs (miRNAs) are potential biomarkers for cancer diagnosis, prognosis and treatment monitoring. Specific detection and absolute quantification of miRNAs is of clinical relevance for early cancer detection and monitoring progression. The currently available techniques for miRNA detection based on DNA amplification are limited by lack of absolute quantification, low multiplexing capacity and time consumption. Here, I propose to develop a miRNA assay system based on self-assembled nanoscale DNA origami arrays (miRanDa) for the simultaneous detection of multiple miRNA targets from breast cancer cells and plasma by using DNA-PAINT, state-of-art super resolution technique. The formation of specifically configured finite 2D lattices of self-assembled DNA origami structures based on sticky-end hybridization will further improve the capacity of the detection system beyond the currently available techniques. This assay can be further developed and adapted to the rapid, specific, sensitive and multiple detection of additional nucleic acid species, such as ctDNA, mRNA or lncRNA.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.

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Coordinateur

UNIVERSITE DE FRIBOURG
Contribution nette de l'UE
€ 203 149,44
Adresse
AVENUE DE L EUROPE 20
1700 Fribourg
Suisse

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Région
Schweiz/Suisse/Svizzera Espace Mittelland Fribourg / Freiburg
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total
€ 203 149,44