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Dissecting and Engineering Allosteric Activation in a Biosynthetic Enzyme

Descripción del proyecto

Exploración de la acción enzimática

Las enzimas son los catalizadores de la naturaleza y reducen la energía necesaria para que se produzcan reacciones, lo que hace que resulten posibles a velocidades que son fisiológicamente relevantes y sin una gran cantidad de «esfuerzo». Por supuesto, del mismo modo que las enzimas regulan la velocidad de las reacciones, es necesario regular la actividad de las enzimas para que estas no se encuentren siempre activas ni permanentemente inactivadas. La regulación alostérica, la regulación de una enzima por una molécula que se fija en un punto distinto al punto activo de la enzima, es común en la naturaleza y admirada por los biólogos sintéticos. Conocer mejor este mecanismo molecular podría ser importante para diversos campos que van desde la industria química hasta los productos farmacéuticos y la biotecnología. El proyecto financiado con fondos europeos DEAllAct investiga un sistema enzimático natural y su modulación. La información obtenida servirá de base para un modelo, una herramienta de simulación que podría predecir qué residuos tienen una importancia vital para la fijación del regulador a su enzima.

Objetivo

"Allosteric regulation of enzyme catalysis is widespread in nature and presents challenges and opportunities in synthetic biology. The enzyme ATP-phosphoribosyltransferase (ATPPRT) catalyses the first step in histidine biosynthesis, and is subject to complex allosteric inhibition by histidine. The short form of the enzyme, HisGS, is found in complex with a regulatory protein, HisZ. Such regulatory protein has a dual function: it allosterically enhances catalysis by HisGS, and it binds histidine and therefore mediates allosteric inhibition. The scientific aim of ""DEAllAct"" is to explore the design of a computational framework by combining state-of-the-art EVB/MM computational simulations and biophysical experimental studies to discover specific mutations at the protein-protein interface between HisGS and HisZ, that directly impact the transmission mechanism of the allosteric regulation. The fellow, Marina Corbella will carry out the project in Uppsala University under the supervision of Prof. Lynn Kamerlin who has extensive experience in computational chemistry and enzyme evolution. The first goal of ""DEAllAct"" is to elucidate the molecular details of the catalytic process of HisGS in the absence/presence of the regulatory protein HisZ via molecular dynamics simulations. Based on the information extracted from these simulations, a novel simulation tool will be developed to predict residues of key importance for binding interactions between the enzyme and the regulatory protein. Finally, the fellow will undergo a secondment at the University of St Andrews to test the hypothesis experimentally by introducing gain-of-function mutations on HisGS at the protein-protein interface to mimic the allosteric activation. Altogether, ""DEAllAct"" will provide the fellow with a highly competitive multidisciplinary profile by complementing her previous acquired expertise, putting her in a strong position to initiate her career as an independent and innovative research leader."

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) H2020-MSCA-IF-2019

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

UPPSALA UNIVERSITET
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 203 852,16
Dirección
VON KRAEMERS ALLE 4
751 05 Uppsala
Suecia

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Región
Östra Sverige Östra Mellansverige Uppsala län
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

€ 203 852,16
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