Description du projet
Le genre Burkholderia: ami ou ennemi?
Les bactéries appartenant au genre Burkholderia interagissent avec leur hôte de différentes manières: mutualisme, commensalisme ou encore pathogénicité. Si certaines espèces sont bénéfiques pour les plantes, d’autres, comme B. cenocepacia, entraînent des infections graves chez les patients atteints de mucoviscidose et immunodéprimés. Le projet GOOD OR BAD BUGS, financé par l’UE, vise à étudier les différences entre les espèces bénéfiques et pathogènes du genre Burkholderia. Les travaux des chercheurs se fondent sur l’hypothèse selon laquelle ce sont les différences génomiques qui déterminent la colonisation et les interactions avec l’hôte. Les chercheurs vont employer la méthode de criblage génétique à haut débit de séquençage des transposons afin d’identifier les gènes associés à l’aptitude bactérienne dans un environnement donné. Les résultats du projet ont d’importantes incidences sur les domaines de l’agriculture et de la médecine.
Objectif
                                """What better microbial challenge to unite agricultural and medical microbiologists than a microoorganism that reduces an onion to a macerated pulp, protects crops from diseases, devastates the health and social life of cystic fibrosis patients, and not only is resistant to the most famous antibiotic, penicillin, but can use it as a nutrient!"". The genus Burkholderia accommodates around 120 species that colonize a wide range of ecological niches and interact with hosts in different ways such as mutualism, commensalism or pathogenicity. Opportunistic pathogens like B. cenocepacia cause severe infections in cystic fibrosis and immunocompromised patients, and mutualists such as B. phytofirmans are beneficial to plants. Although very promising for agriculture, the use of the latter is severely  restrained due to the potential threat that a few opportunistic pathogenic strains pose to human health. In the last years, a lot of effort has been invested into discriminating between the beneficial and the pathogenic strains. However, these studies have been unsuccessful so far and novel approaches are needed to better understand the potential risks/benefits associated to Burkholderia species before these can keep being used in agriculture.
Friends or foes? The GOOD OR BAD BUGS project aims to unravel the dissimilarities between the beneficial (the good) and the pathogenic (the bad) Burkholderia species. We hypothesize that differences in the genomes of the  Burkholderia species allow them to colonize and interact with their host differently, leading to mutualism, commensalism or pathogenicity. In this project we will employ a cutting-edge high-throughput genetic screening method known as transposon-sequencing to study host colonization by members of the genus Burkholderia. This promising methodology will help to identify genes that provide a fitness in a particular environment. The outcome of the project will be of interest both at the agriculture and the medicine levels."
                            
                                Champ scientifique (EuroSciVoc)
                                                                                                            
                                            
                                            
                                                CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir:   Le vocabulaire scientifique européen.
                                                
                                            
                                        
                                                                                                
                            CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique antibiotique
 - sciences naturelles sciences biologiques sciences biologiques du comportement éthologie interaction biologique
 - sciences agricoles agriculture, sylviculture et pêche agriculture
 - sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
 
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                                        Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
                                        
                                    
                                
                            
                            
                        Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
            Programme(s)
            
              
              
                Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
                
              
            
          
                      Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
- 
                  H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
                                      PROGRAMME PRINCIPAL
                                    
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                  H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
                                    
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            Thème(s)
            
              
              
                Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
                
              
            
          
                      
                  Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
            Régime de financement
            
              
              
                Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
                
              
            
          
                      Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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              Appel à propositions
                
                  
                  
                    Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
                    
                  
                
            
                          Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
8006 Zurich
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.