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Profiling the emergence of phenotypic heterogeneity in breast cancer organoids

Descripción del proyecto

Identificar la heterogeneidad de los tumores mediante organoides

Numerosas pruebas indican que la heterogeneidad celular favorece la neoplasia maligna e induce resistencia al tratamiento. Sin embargo, se carece de información fundamental sobre su aparición, tanto a nivel espacial como temporal. Para abordar esta cuestión, en el proyecto financiado con fondos europeos SpatialOrganoids se llevarán a cabo análisis experimentales y computacionales de cultivos de organoides tridimensionales de cáncer de mama a lo largo del tiempo. Al captar los cambios espaciotemporales en los fenotipos celulares, los científicos identificarán los determinantes moleculares y espaciales de la heterogeneidad del cáncer de mama. Habida cuenta de la elevada incidencia del cáncer de mama en las mujeres y de la amplia heterogeneidad intra- e interpaciente, los resultados del proyecto contribuirán a la elaboración de nuevas estrategias de tratamiento selectivo.

Objetivo

Cell-to-cell heterogeneity in biological systems has been broadly studied in unicellular organisms and mammals. Furthermore, non-genetic, in addition to genetic heterogeneity has been recently proposed to support tumour growth and to induce resistance to cancer therapy. However, the molecular events on a spatial and temporal level that lead to the emergence of tumour heterogeneity are largely unknown. To address this question, I will study breast cancer, which shows the highest cancer incidence in women and is characterised by extensive intra- and inter-patient heterogeneity in cellular and molecular phenotypes. As model system, I select 3D organoid cultures, which are gaining popularity in cancer research due to their ability to reconstruct tumour-like molecular features and to recapitulate treatment response.
Here, I propose experimental and computational time-course analyses of breast cancer organoids to understand molecular and spatial determinants that underlie the emergence of heterogeneity in cancer cell phenotypes. On the experimental side, I will use imaging mass cytometry and perturbation experiments to capture and validate spatio-temporal changes in cellular phenotypes, interactions and signalling networks. Statistical modelling will quantify dynamic changes in phenotypic heterogeneity over the time-course of organoid growth. Finally, I will predict the emergence of intra-organoid heterogeneity across multiple organoid lines, which allows me to derive targeted treatment strategies.
In sum, the proposed work will disentangle and perturb the spatio-temporal emergence of phenotypic intra-tumour heterogeneity, which is characteristic of breast cancer tissues.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

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Coordinador

UNIVERSITAT ZURICH
Aportación neta de la UEn
€ 191 149,44
Dirección
RAMISTRASSE 71
8006 Zurich
Suiza

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Región
Schweiz/Suisse/Svizzera Zürich Zürich
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total
€ 191 149,44