Description du projet
Décoder le co-assemblage
Un assemblage de composants réunis à différentes étapes aboutit au co-assemblage. Le co-assemblage est principalement employé pour la formation d’homo-oligomères et existe dans tous les règnes de la nature. Nous savons pourtant très peu de choses sur les mécanismes moléculaires qui l’entraînent. Le projet Co-coAssembly, financé par l’UE, étudiera les mécanismes du co-assemblage à l’aide de la chorismate mutase dimérique comme principale représentante issue d’un criblage à haut débit des complexes protéiques en co-assemblage d’E. coli. À l’aide d’une tomographie spéciale, l’étude sera axée sur l’agencement en trois dimensions des ribosomes d’E. coli pour déterminer la manière dont l’organisation de la machinerie translationnelle permet le co-assemblage.
Objectif
Almost all fundamental biological processes involve protein complexes and therefore, efficient folding and assembly of homo- and hetero-oligomers is critical for cellular functionality and integrity. Recent studies have shown that many protein complexes assemble co-translationally by one fully-synthesized subunit engaging another subunit that is still in nascent state (co-post assembly). An ongoing study in the Bukau lab now revealed that assembly can also occur by interaction of two partner nascent chains (co-co assembly). Co-co assembly is mostly employed for the formation of homo-oligomers and exists in all kingdoms of life..
Despite initial evidence of its existence, very little is known about the molecular mechanisms driving co-co assembly. This includes information on whether co-co assembly requires co-localization of two polysomes or can happen on one polysome.. Furthermore, it is currently unclear whether co-co interactions require preceding nascent chain folding steps and to what extent co-translationally acting chaperones coordinate the process and the impact of translation speed on co-co assembly.
I propose to study mechanisms of co-co assembly using the dimeric chorismate mutase (PheA) as a representative top candidate from a high throughput screen for co-co assembling protein complexes in E. coli. Employing cryo-electron tomography, I will analyse the three dimensional arrangement of E. coli ribosomes in the context of a polysome to assess how organization of translational machinery allows co-co assembly. Moreover, I will study the co-translational cascade of folding steps of chorismate mutase by utilizing FRET on in vitro prepared nascent chains. Finally, I plan to explore the impact of co-translationally acting chaperones and translation kinetics on co-co assembly, by performing disome-selective profiling analysis in chaperone mutant cells lacking Trigger Factor and DnaK and in mutants that synthesize proteins with reduced translation kinetics.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie electron microscopy
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
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H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
69117 Heidelberg
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.