Description du projet
Séquençage in situ pour cartographier les interactions cellulaires dans la muqueuse intestinale
Dans des conditions physiologiques, l’épithélium intestinal constitue une barrière physique dynamique servant de première ligne de défense immunitaire. Une monocouche de cellules épithéliales intestinales spécialisées endommagée induit une perturbation de l’homéostasie immunitaire intestinale et conduit à des maladies inflammatoires de l’intestin (MII), comme la colite ulcéreuse et la maladie de Crohn. Compte tenu de l’augmentation de l’incidence des MII dans les sociétés modernes, les scientifiques du projet GUTMAPS, financé par l’UE, étudieront les tissus intestinaux dans une résolution sans précédent. Pour ce faire, ils effectueront un séquençage in situ pour profiler les cellules individuelles, cartographier les interactions cellule-cellule et aider à créer une meilleure compréhension de cet organe en matière de santé et de maladie.
Objectif
The intestinal epithelium is the first line of defence of the mucosal immune system because it acts as a dynamic physical barrier segregating the luminal content from the underlying mucosal tissue. This barrier is mainly formed by a monolayer of specialised intestinal epithelial cells (IECs) that are crucial in maintaining intestinal homeostasis. Damage to this epithelial layer can increase intestinal permeability and lead to abnormalities in interactions between IECs, stromal cells and immune cells in the underlying lamina propria thereby disturbing the intestinal immune homeostasis, all of which are a hallmark of several intestinal disorders including inflammatory bowel diseases (IBD). Ulcerative colitis (UC) and Crohn’s disease (CD) are the two major forms of IBD, affecting an estimated 4 million people in the United States and Europe and have a rising incidence in the developing world. Recent single cell RNA seq (scRNAseq) studies of the intestine have allowed us to understand this organ in unprecedented detail, however, such studies still require the dissociation of tissue and loss of spatial resolution. With this project, I would like to take advantage of recent advances in in-situ sequencing to study intestinal tissue in toto and by combining this with the available scRNA-seq data, generate spatial maps of the intestine (GUTMAPS). The results obtained here will allow us to look at tissue composition and cell-cell interactions with unprecedented resolution in normal and diseased mucosa.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement géographie physique cartographie
- sciences médicales et de la santé médecine clinique gastroentérologie maladie inflammatoire chronique de l’intestin
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie homéostasie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.3. - EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions
PROGRAMME PRINCIPAL
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme -
H2020-EU.1.3.2. - Nurturing excellence by means of cross-border and cross-sector mobility
Voir tous les projets financés dans le cadre de ce programme
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) H2020-MSCA-IF-2019
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
3015 GD Rotterdam
Pays-Bas
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.