Elucidating transcriptional rewiring on hematological malignancies via computational methods

Información del proyecto

LINKER

Identificador del acuerdo de subvención: 898356

DOI 10.3030/898356

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 24 Febrero 2020

Fecha de inicio 1 Marzo 2020

Fecha de finalización 28 Febrero 2022

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coste total € 172 932,48

Aportación de la UE € 172 932,48

Coordinado por

FUNDACION PARA LA INVESTIGACION MEDICA APLICADA FIMA
Spain

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Publicaciones

Peer reviewed articles (2)

SimiC enables the inference of complex gene regulatory dynamics across cell phenotypes

Autores: Jianhao Peng, Guillermo Serrano, Ian M. Traniello, Maria E. Calleja-Cervantes, Ullas V. Chembazhi, Sushant Bangru, Teresa Ezponda, Juan Roberto Rodriguez-Madoz, Auinash Kalsotra, Felipe Prosper, Idoia Ochoa & Mikel Hernaez
Publicado en: Communications Biology, Edición number 5, 351 (2022), 2022, ISSN 2399-3642
Editor: Springer
DOI: 10.1038/s42003-022-03319-7

JIND: joint integration and discrimination for automated single-cell annotation

Autores: Mohit Goyal, Guillermo Serrano, Josepmaria Argemi, Ilan Shomorony, Mikel Hernaez, Idoia Ochoa
Publicado en: Bioinformatics, 2022, ISSN 1367-4803
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac140

Other (3)

Transcriptional regulation of HSCs in Aging and MDS reveals DDIT3 as a Potential Driver of Dyserythropoiesis

Autores: Nerea Berastegui, Marina Ainciburu, Juan P. Romero, Ana Alfonso-Pierola, Céline Philippe, Amaia Vilas, Patxi San Martin, Raquel Ordoñez, Diego Alignani, Sarai Sarvide, Laura Castro, José M. Lamo-Espinosa, Mikel San-Julian, Tamara Jimenez, Félix López, Sandra Muntion, Fermin Sanchez-Guijo, Antonieta Molero, Julia Montoro, Bárbara Tazón, Guillermo Serrano, Aintzane Diaz-Mazkiaran, Mikel H
Publicado en: bioRxiv, Edición 27 Nov 2021, 2021, ISSN 0000-0000
Editor: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2021.09.08.459384

CAR Density Influences Antitumoral Efficacy of BCMA CAR T cells and Correlates with Clinical Outcome

Autores: Paula Rodriguez-Marquez, Maria E. Calleja-Cervantes, Guillermo Serrano, Aina Oliver-Caldes, Maria L. Palacios-Berraquero, Angel Martin-Mallo, Cristina Calviño, Marta Español-Rego, Candela Ceballos, Teresa Lozano, Patxi San Martin-Uriz, Amaia Vilas-Zornoza, Saray Rodriguez-Diaz, Rebeca Martinez-Turrillas, Patricia Jauregui, Diego Alignani, Maria C. Viguria, Margarita Redondo, Mariona Pascal, Man
Publicado en: medRxiv, 2022, ISSN 0000-0000
Editor: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2022.01.19.22269515

Uncovering perturbations in human hematopoiesis associated with healthy aging and myeloid malignancies at single cell resolution

Autores: Marina Ainciburu, Teresa Ezponda, Nerea Berastegui, Ana Alfonso-Pierola, Amaia Vilas-Zornoza, Patxi San Martin-Uriz, Diego Alignani, Jose Lamo de Espinosa, Mikel San Julian, Tamara Jimenez, Félix López, Sandra Muntion, Fermin Sanchez-Guijo, Antonieta Molero, Julia Montoro, Guillermo Serrano, Aintzane Diaz-Mazkiaran, Miren Lasaga, David Gomez-Cabrero, María Díez-Campelo, David Valcarcel, Mikel
Publicado en: bioRxiv, Edición March 16, 2022, 2022, ISSN 0000-0000
Editor: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2021.07.30.454542