Elucidating transcriptional rewiring on hematological malignancies via computational methods

Informations projet

LINKER

N° de convention de subvention: 898356

DOI

10.3030/898356

Projet clôturé

Date de signature de la CE 24 Février 2020

Date de début 1 Mars 2020

Date de fin 28 Février 2022

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - Marie Skłodowska-Curie Actions

Coût total

€ 172 932,48

Contribution de l’UE

€ 172 932,48

Coordonné par

FUNDACION PARA LA INVESTIGACION MEDICA APLICADA FIMA
Spain

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Publications

Peer reviewed articles (2)

SimiC enables the inference of complex gene regulatory dynamics across cell phenotypes

Auteurs: Jianhao Peng, Guillermo Serrano, Ian M. Traniello, Maria E. Calleja-Cervantes, Ullas V. Chembazhi, Sushant Bangru, Teresa Ezponda, Juan Roberto Rodriguez-Madoz, Auinash Kalsotra, Felipe Prosper, Idoia Ochoa & Mikel Hernaez
Publié dans: Communications Biology, Numéro number 5, 351 (2022), 2022, ISSN 2399-3642
Éditeur: Springer
DOI: 10.1038/s42003-022-03319-7

JIND: joint integration and discrimination for automated single-cell annotation

Auteurs: Mohit Goyal, Guillermo Serrano, Josepmaria Argemi, Ilan Shomorony, Mikel Hernaez, Idoia Ochoa
Publié dans: Bioinformatics, 2022, ISSN 1367-4803
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/bioinformatics/btac140

Other (3)

Transcriptional regulation of HSCs in Aging and MDS reveals DDIT3 as a Potential Driver of Dyserythropoiesis

Auteurs: Nerea Berastegui, Marina Ainciburu, Juan P. Romero, Ana Alfonso-Pierola, Céline Philippe, Amaia Vilas, Patxi San Martin, Raquel Ordoñez, Diego Alignani, Sarai Sarvide, Laura Castro, José M. Lamo-Espinosa, Mikel San-Julian, Tamara Jimenez, Félix López, Sandra Muntion, Fermin Sanchez-Guijo, Antonieta Molero, Julia Montoro, Bárbara Tazón, Guillermo Serrano, Aintzane Diaz-Mazkiaran, Mikel H
Publié dans: bioRxiv, Numéro 27 Nov 2021, 2021, ISSN 0000-0000
Éditeur: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2021.09.08.459384

CAR Density Influences Antitumoral Efficacy of BCMA CAR T cells and Correlates with Clinical Outcome

Auteurs: Paula Rodriguez-Marquez, Maria E. Calleja-Cervantes, Guillermo Serrano, Aina Oliver-Caldes, Maria L. Palacios-Berraquero, Angel Martin-Mallo, Cristina Calviño, Marta Español-Rego, Candela Ceballos, Teresa Lozano, Patxi San Martin-Uriz, Amaia Vilas-Zornoza, Saray Rodriguez-Diaz, Rebeca Martinez-Turrillas, Patricia Jauregui, Diego Alignani, Maria C. Viguria, Margarita Redondo, Mariona Pascal, Man
Publié dans: medRxiv, 2022, ISSN 0000-0000
Éditeur: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2022.01.19.22269515

Uncovering perturbations in human hematopoiesis associated with healthy aging and myeloid malignancies at single cell resolution

Auteurs: Marina Ainciburu, Teresa Ezponda, Nerea Berastegui, Ana Alfonso-Pierola, Amaia Vilas-Zornoza, Patxi San Martin-Uriz, Diego Alignani, Jose Lamo de Espinosa, Mikel San Julian, Tamara Jimenez, Félix López, Sandra Muntion, Fermin Sanchez-Guijo, Antonieta Molero, Julia Montoro, Guillermo Serrano, Aintzane Diaz-Mazkiaran, Miren Lasaga, David Gomez-Cabrero, María Díez-Campelo, David Valcarcel, Mikel
Publié dans: bioRxiv, Numéro March 16, 2022, 2022, ISSN 0000-0000
Éditeur: Cold Spring Harbor
DOI: 10.1101/2021.07.30.454542