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Role of Metabolic INteractions in the Eco-evolutionary dynamics of bacteRial communities in the VAgina

Descrizione del progetto

Le interazioni metaboliche dei batteri nella vagina

La vaginosi batterica (VB) è una sindrome caratterizzata da un cambiamento nella composizione del microbiota vaginale da batteri che producono acido lattico ad altre specie di batteri. La VB impone un onere significativo e nascosto su moltissime donne in tutto il mondo. Le secrezioni vaginali in donne che soffrono di VB presentano livelli elevati di molecole di zucchero, note come acidi sialici, utilizzati da alcuni batteri come una fonte di nutrienti e un modo per sfuggire all’immunità dell’ospite. L’obiettivo chiave del progetto MINERVA, finanziato dall’UE, consiste nello studio del metabolismo degli acidi sialici nei batteri associati alla VB da un punto di vista genetico, clinico ed evolutivo, utilizzando modelli di laboratorio e campioni clinici. Proponiamo l’identificazione dei geni metabolici degli acidi sialici e le loro interazioni all’interno di reti di specie batteriche, con l’obiettivo di ridurre l’onere della VB, le complicazioni riproduttive associate e il rischio di contrarre infezioni sessualmente trasmissibili.

Obiettivo

Bacterial vaginosis (BV) is a polymicrobial syndrome that modifies vaginal secretions and increases risks of reproductive complications and most sexually transmissible infections. This syndrome is associated with a shift in vaginal microbiota composition from lactic-acid producing bacteria to specific bacterial communities. Concomitant with such shift, sialidases can be detected in vaginal secretions where they release sialic acids (SA), sugar molecules that some bacteria can use as a nutrient source and to escape host’s immunity. While the presence of sialidases is used as a BV diagnosis method, we still know little about SA metabolism in the species associated with BV, and even less about SA-related interactions in the community.
The proposed project will directly address this question with the ultimate aim of understanding the role of SA metabolism in the transition from health to disease. I will focus my research on the three most prevalent BV-associated bacteria: Gardnerella vaginalis, Prevotella bivia and Atopobium vaginae. First, I will investigate the genomic organization and distribution of the genes involved in SA metabolism. Second, I will link these genotypes to phenotypes by experimentally assessing the expression of those genes in clinical samples from BV-positive and negative women. Third, I will assess the evolutionary stability of SA metabolism genes and bring insight into the respective roles of SA availability and host’s immune system in the evolution of bacterial SA metabolism. Finally, I will create ex-vivo minimal model communities of BV bacteria and examine the ecological interactions between species.
By going beyond a taxonomic description to better understand eco-evolutionary functioning, this project will expand our view of the BV microbiome both at the species level, examining in particular intraspecies diversity in genetic composition and expression, and at the community level through the investigation of SA-related interactions.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MSCA-IF - Marie Skłodowska-Curie Individual Fellowships (IF)

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) H2020-MSCA-IF-2019

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 184 707,84
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 184 707,84
Il mio fascicolo 0 0