Unravelling the pRotein Allosterome of Gene Expression

Información del proyecto

proteoRAGE

Identificador del acuerdo de subvención: 948544

DOI

10.3030/948544

Fecha de la firma de la CE 20 Agosto 2020

Fecha de inicio 1 Julio 2021

Fecha de finalización 31 Agosto 2027

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coste total

€ 1 684 594,00

Aportación de la UE

€ 1 684 594,00

Coordinado por

MAX DELBRUECK CENTRUM FUER MOLEKULARE MEDIZIN IN DER HELMHOLTZ-GEMEINSCHAFT (MDC)
Germany

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Publicaciones

Peer reviewed articles (8)

Pooled overexpression screening identifies PIPPI as a novel microprotein involved in the ER stress response

Autores: Lorenzo Lafranchi, Glancis Luzeena Raja, Alberto M Arenas, Anna Spinner, Kovi R Shrung, Maximilian Hornisch, Dörte Schlesinger, Carmen Navarro Luzon, Linus Brinkenstråhle, Rui Shao, Ilaria Piazza, Janne Lehtiö, Rui M M Branca, Simon J Elsӓsser
Publicado en: Nucleic Acids Research, Edición 53, 2025, ISSN 0305-1048
Editor: Oxford University Press
DOI: 10.1093/nar/gkaf1072

The potential of cross-linking mass spectrometry in the development of protein–protein interaction modulators

Autores: Max Ruwolt; Ilaria Piazza; Fan Liu
Publicado en: Current Opinion in Structural Biology, 2023, ISSN 0959-440X
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.sbi.2023.102648

Regulation of gene expression through protein-metabolite interactions

Autores: Maximilian Hornisch, Ilaria Piazza
Publicado en: npj Metabolic Health and Disease, Edición 3, 2025, ISSN 2948-2828
Editor: Springer Science and Business Media LLC
DOI: 10.1038/s44324-024-00047-w

Differential regulation of mRNA stability modulates transcriptional memory and facilitates environmental adaptation

Autores: Bignan Li, Patrice Zeis, Jujie Zhang, Alisa Alekseenko, Eliska Fuerst, Yerma Pareja Sanchez, Ge Lin, Manu Tekkedil, Ilaria Piazza, Lars Steinmetz, Vicent Pelechano
Publicado en: Nature Communications, 2023, ISSN 2041-1723
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-023-36586-x

Benchmarking of Quantitative Proteomics Workflows for Limited Proteolysis Mass Spectrometry

Autores: Tomas Koudelka, Claudio Bassot, Ilaria Piazza
Publicado en: Molecular & Cellular Proteomics, Edición 24, 2025, Página(s) 100945, ISSN 1535-9476
Editor: American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc.
DOI: 10.1016/j.mcpro.2025.100945

Ribosomes modulate transcriptome abundance via generalized frameshift and out-of-frame mRNA decay

Autores: Yujie Zhang, Lilit Nersisyan, Eliska Fürst, Ioannis Alexopoulos, Carlos Santolaria, Susanne Huch, Claudio Bassot, Elena Garre, Per Sunnerhagen, Ilaria Piazza, Vicent Pelechano
Publicado en: Molecular Cell, Edición 85, 2025, Página(s) 2017-2031.e7, ISSN 1097-2765
Editor: Cell Press
DOI: 10.1016/j.molcel.2025.04.022

Comparison of Xrn1 and Rat1 5′ → 3′ exoribonucleases in budding yeast supports the specific role of Xrn1 in cotranslational mRNA decay

Autores: José E. Pérez‐Ortín, Antonio Jordán‐Pla, Yujie Zhang, Jorge Moreno‐García, Claudio Bassot, Marina Barba‐Aliaga, Leire de Campos‐Mata, Mordechai Choder, Juana Díez, Ilaria Piazza, Vicent Pelechano, José García‐Martínez
Publicado en: Yeast, Edición 41, 2024, Página(s) 458-472, ISSN 0749-503X
Editor: John Wiley & Sons Inc.
DOI: 10.1002/yea.3968

The rise of proteome-wide biophysics

Autores: Andre Mateus, Mikhail Savitski, Ilaria Piazza
Publicado en: Molecular Systems Biology, 2021, ISSN 1744-4292
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.15252/msb.202110442