Descripción del proyecto
El papel de las interacciones proteína-metabolito en la expresión genética
Las señales ambientales, como las moléculas y los metabolitos de pequeño tamaño, impulsan en gran medida la fisiología celular. Las proteínas perciben estas señales ambientales interactuando directamente con estas moléculas, y se desencadenan variaciones rápidas de la actividad de las proteínas como respuesta. El equipo científico del proyecto financiado con fondos europeos proteoRAGE, que se encarga de investigar estas interacciones alostéricas, está interesado en entender cómo dichas interacciones pueden controlar la expresión genética. A través de un novedoso enfoque proteómico, planea estudiar el resultado funcional de las interacciones específicas proteína-metabolito a nivel del genoma, la estructura de la proteína y el fenotipo, lo que proporcionará información importante sobre su modulación.
Objetivo
Understanding how different environmental cues influence cellular physiology is critical but challenging. Small molecule metabolites such as nutrients and signalling molecules carry information about the external and internal state of the cell. Proteins sense these environmental signals through direct physical interactions with metabolites that trigger rapid variations of protein activities as response. Those events where protein and metabolites interact leading to functional consequences are called allosteric interactions. Allosteric interactions are classically studied in the context of enzymatic reactions, but much less is known regarding their potential ability to control gene expression. I propose to test the hypothesis that metabolites can, in some cases, bypass classical signaling pathways and act directly on gene expression. To address this question, I will study systematically the proteins that regulate gene expression (i.e. transcription and translation) and that can be directly activated (or inhibited) by interactions with metabolites. Building on my previous work studying metabolite-protein interactions using limited proteolysis, I will apply novel mass spectrometry-based proteomics approaches to investigate the gene expression allosterome. I will couple the measurement of structural changes caused by protein-metabolite interactions with their direct effects on chromatin accessibility and mRNA-protein associations. By measuring those effects in vivo, I will link allosteric interactions with gene expression activity. Finally, I will validate their functional role by integrating structural information with deep mutagenesis and cellular phenotyping in multiple environments. In summary, my research aims to establish a novel interdisciplinary approach to functionally characterize the complexity of the allosterome, to identify novel entry points for its modulation using small molecules and to refine our understanding of gene expression.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias médicas y de la salud medicina básica fisiología
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
ERC-STG - Starting Grant
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2020-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
13125 Berlin
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.