Elucidating the mechanisms, heterogeneity and role of epigenetic topological alterations in cancer

Projektinformationen

CancerEpiTopology

ID Finanzhilfevereinbarung: 949029

DOI

10.3030/949029

Projekt abgeschlossen

EK-Unterschriftsdatum 15 Januar 2021

Startdatum 1 Februar 2021

Enddatum 31 Januar 2026

Finanziert unter

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Gesamtkosten

€ 1 500 000,00

EU-Beitrag

€ 1 500 000,00

Koordiniert durch

THE HEBREW UNIVERSITY OF JERUSALEM
Israel

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Veröffentlichungen

Peer reviewed articles (3)

Accurate estimation of pathway activity in single cells for clustering and differential analysis

Autoren: Daniel Davis, Avishai Wizel, Yotam Drier
Veröffentlicht in: Genome Research, 2024, ISSN 1088-9051
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory Press
DOI: 10.1101/gr.278431.123

Single-cell RNA sequencing identifies a paracrine interaction that may drive oncogenic notch signaling in human adenoid cystic carcinoma

Autoren: Anuraag S. Parikh, Avishai Wizel, Daniel Davis, Armida Lefranc-Torres, Alejandro I. Rodarte-Rascon, Lauren E. Miller, Kevin S. Emerick, Mark A. Varvares, Daniel G. Deschler, William C. Faquin, Jon C. Aster, Derrick T. Lin, Bradley E. Bernstein, Yotam Drier, Sidharth V. Puram
Veröffentlicht in: Cell reports, 2022, ISSN 2211-1247
Herausgeber: Cell Press
DOI: 10.1016/j.celrep.2022.111743

Single-cell transcriptomic analysis of HPV-related multiphenotypic sinonasal carcinoma uncovers MYB-HPV association

Autoren: Avishai Wizel, Matthew D. A. Spence, Michael Mints, William Britton, Ogoegbunam Okolo, Victoria Yu, Isabel Cioffi, Salvatore Caruana, Scott H. Troob, William C. Faquin, Derrick T. Lin, Itay Tirosh, Sidharth V. Puram, Anuraag S. Parikh, Yotam Drier
Veröffentlicht in: npj Precision Oncology, Ausgabe 9, 2025, ISSN 2397-768X
Herausgeber: Springer Nature
DOI: 10.1038/s41698-025-01164-5

Other (2)

A novel method to accurately estimate pathway activity in single cells for clustering and differential analysis

Autoren: Daniel Davis, Avishai Wizel, Yotam Drier
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2023
Herausgeber: biorxiv
DOI: 10.1101/2023.03.27.534310

Single-cell transcriptomic analysis of HPV-related multiphenotypic sinonasal carcinoma uncovers MYB-HPV association

Autoren: Avishai Wizel, Matthew D. A. Spence, Michael Mints, William Britton, Ogoegbunam Okolo, Victoria Yu, Isabel Cioffi, Salvatore Caruana, Scott H. Troob, William C. Faquin, Derrick T. Lin, Itay Tirosh, Sidharth V. Puram, Anuraag S. Parikh, Yotam Drier
Veröffentlicht in: bioRxiv, 2025
Herausgeber: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.04.21.649795