Description du projet
Signification fonctionnelle de la localisation des ARNm dans les cellules épithéliales digestives
Une distribution subcellulaire asymétrique des ARNm a été observée dans une variété de cellules et d’organismes polarisés. La polarisation des ARN au début de la vie détermine les gradients morphogènes nécessaires à la formation de l’embryon. On ignore encore comment fonctionne le mécanisme de tri des transcriptions et comment il maintient la ségrégation des ARN dans le cytoplasme. Le projet RNAloc, financé par l’UE, combinera la microscopie ARN et la protéomique de proximité subcellulaire pour étudier la contribution fonctionnelle de la localisation des ARNm dans les épithéliums digestifs. Cette boîte à outils innovante permettra la cartographie spatiale de l’ARN et des protéines, ce qui conduira à l’identification de l’espace subcellulaire et de la signification biologique de ce processus fondamental dans les épithéliums adultes.
Objectif
Asymmetric subcellular mRNA distributions have been observed in a variety of polar cell types and organisms. RNA polarization is instrumental at the beginning of life and determines the morphogen gradients needed for embryo patterning. In highly polar neurons, subcellular transcript localization and translation are thought to enhance cellular efficiency and timely responses to extrinsic cues. However, the functional consequence of mRNA localization has, in most cases, not been elucidated. We have shown that a large fraction of an epithelial transcriptome is localized, yet the role(s) of mRNA localization in adult tissue homeostasis and function are unknown. Moreover, we still do not know how the transcript sorting machinery works, and we lack insights into the molecular composition of the membrane-less compartments that may maintain RNA segregation in the cytoplasm.
We will address these gaps by combining RNA microscopy and subcellular proximity proteomics to study the functional contribution of RNA localization in digestive epithelia. Our project will comprehensively map the subcellular space across three adult epithelial tissues – liver, jejunum, and colon. To elucidate the mechanisms that mediate sequence-specific mRNA transport and maintain localization, we will develop a system to tether a construct for proximity proteomics to localized RNAs. We will functionally test the contribution of RNA localization to tissue homeostasis and disease development by disrupting the localizing elements and machinery.
Our novel toolkit will enable the spatial mapping of RNA and proteins in parallel, allowing us to annotate the subcellular space and subsequently probe the biological significance of this fundamental process in adult epithelia. This novel technology can be extended to the subcellular study of all epithelia and tissues in general; it will ultimately lead to a more comprehensive understanding of tissue function in homeostasis and disease.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines protéomique
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie pathophysiologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
- sciences médicales et de la santé médecine clinique embryologie
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale physiologie homéostasie
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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H2020-EU.1.1. - EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
ERC-STG - Starting Grant
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
8092 Zuerich
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.