Description du projet
Signification fonctionnelle de la localisation des ARNm dans les cellules épithéliales digestives
Une distribution subcellulaire asymétrique des ARNm a été observée dans une variété de cellules et d’organismes polarisés. La polarisation des ARN au début de la vie détermine les gradients morphogènes nécessaires à la formation de l’embryon. On ignore encore comment fonctionne le mécanisme de tri des transcriptions et comment il maintient la ségrégation des ARN dans le cytoplasme. Le projet RNAloc, financé par l’UE, combinera la microscopie ARN et la protéomique de proximité subcellulaire pour étudier la contribution fonctionnelle de la localisation des ARNm dans les épithéliums digestifs. Cette boîte à outils innovante permettra la cartographie spatiale de l’ARN et des protéines, ce qui conduira à l’identification de l’espace subcellulaire et de la signification biologique de ce processus fondamental dans les épithéliums adultes.
Objectif
Asymmetric subcellular mRNA distributions have been observed in a variety of polar cell types and organisms. RNA polarization is instrumental at the beginning of life and determines the morphogen gradients needed for embryo patterning. In highly polar neurons, subcellular transcript localization and translation are thought to enhance cellular efficiency and timely responses to extrinsic cues. However, the functional consequence of mRNA localization has, in most cases, not been elucidated. We have shown that a large fraction of an epithelial transcriptome is localized, yet the role(s) of mRNA localization in adult tissue homeostasis and function are unknown. Moreover, we still do not know how the transcript sorting machinery works, and we lack insights into the molecular composition of the membrane-less compartments that may maintain RNA segregation in the cytoplasm.
We will address these gaps by combining RNA microscopy and subcellular proximity proteomics to study the functional contribution of RNA localization in digestive epithelia. Our project will comprehensively map the subcellular space across three adult epithelial tissues – liver, jejunum, and colon. To elucidate the mechanisms that mediate sequence-specific mRNA transport and maintain localization, we will develop a system to tether a construct for proximity proteomics to localized RNAs. We will functionally test the contribution of RNA localization to tissue homeostasis and disease development by disrupting the localizing elements and machinery.
Our novel toolkit will enable the spatial mapping of RNA and proteins in parallel, allowing us to annotate the subcellular space and subsequently probe the biological significance of this fundamental process in adult epithelia. This novel technology can be extended to the subcellular study of all epithelia and tissues in general; it will ultimately lead to a more comprehensive understanding of tissue function in homeostasis and disease.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/en/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- sciences naturellessciences biologiquesbiochimiebiomoléculeprotéinesprotéomique
- sciences médicales et de la santémédecine fondamentalephysiologiepathophysiologie
- sciences naturellessciences biologiquesgénétiqueARN
- sciences médicales et de la santémédecine cliniqueembryologie
- sciences médicales et de la santémédecine fondamentalephysiologiehoméostasie
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Mots‑clés
Programme(s)
Thème(s)
Appel à propositions
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2020-STG
Voir d’autres projets de cet appelRégime de financement
ERC-STG - Starting GrantInstitution d’accueil
8092 Zuerich
Suisse