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Zygotic Cell Fate and Parent-Biased Gene Expression in Fission Yeast

Descrizione del progetto

Capire perché in tre si è in troppi nell’accoppiamento del lievito di fissione e chi dei due domina

I lieviti di fissione sono organismi unicellulari eucarioti unici che sono diventati un sistema modello di elezione per studiare i processi conservati dai lieviti agli esseri umani, ma assenti nei batteri. A differenza dei loro omologhi lieviti che si riproducono per gemmazione, le cellule madri del lievito di fissione si dividono in due cellule figlie identiche e sono quindi preziose per gli studi sui gameti, gli zigoti e l’espressione allelica. Il progetto ZygoticFate, finanziato dall’UE, sta sfruttando questi funghi in studi volti a chiarire i segnali e i percorsi che impediscono a uno zigote appena formato di accoppiarsi di nuovo e che regolano l’errore nell’espressione degli alleli genitoriali. Questo approfondimento sarà rilevante per numerosi organismi e applicazioni in tutto il regno animale e vegetale.

Obiettivo

As two gametes fuse, the newly formed zygote immediately represses mating, to prevent polyploid formation, and triggers the developmental program that gives rise to a new individual. My work showed that zygotes of fission yeast and higher eukaryotes bare striking similarities, and here I propose to use this powerful model system to explore the basic mechanisms of gamete-to-zygote transition. Working in fission yeast, where gametes and zygotes are well-defined and accessible to outstanding plethora of experimental approaches, will show how different regulatory mechanisms synergize to execute this key cell fate switch.
Our first aim explores zygotic regulation of gene expression and mating blocks. First, to show how zygote-specific signaling propagates, we will identify its targets using biochemical screens. Second, we will analyse how zygotes alter gene expression. High-throughput sequencing will show transcriptional dynamics and genetics approaches will test its regulation and relevance. Third, we will combine microscopy and genetics to reveal the workings of fungal re-fertilization blocks.
Our second aim explores roles and regulation of the parent-biased allele expression in fungal zygotes that I recently discovered. While biochemical and sequencing-based screens will identify genes asymmetrically expressed from parental genomes, genetics strategies will test their roles. A structural biology workpackage will show how a simple homeodomain transcription factor drives the bias between parental genomes.
Similarities between zygotes of fission yeast and higher eukaryotes hint to the relevance of our work for other developmental systems. By understanding fungal blocks to re-fertilization, which have been previously completely overlooked, we may identify their conserved principles, as increasingly evident for other sexual processes. Finally, exploring the bias in expression of parental alleles in yeast may help explain its recurrence in distant plant and animal lineages.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-STG - Starting Grant

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) ERC-2020-STG

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Istituzione ospitante

UNIVERSITE DE LAUSANNE
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 1 702 705,00
Indirizzo
QUARTIER UNIL CENTRE - BATIMENT UNICENTRE
1015 LAUSANNE
Svizzera

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Regione
Schweiz/Suisse/Svizzera Région lémanique Vaud
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

€ 1 702 705,00

Beneficiari (1)

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