Switchable rhodOpsins in Life Sciences

Informations projet

SOL

N° de convention de subvention: 951644

DOI

10.3030/951644

Date de signature de la CE 7 Février 2021

Date de début 1 Septembre 2022

Date de fin 31 Août 2028

Financé au titre de

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Coût total

€ 7 971 388,75

Contribution de l’UE

€ 7 971 388,75

Coordonné par

PAUL SCHERRER INSTITUT
Switzerland

CORDIS fournit des liens vers les livrables publics et les publications des projets HORIZON.

Les liens vers les livrables et les publications des projets du 7e PC, ainsi que les liens vers certains types de résultats spécifiques tels que les jeux de données et les logiciels, sont récupérés dynamiquement sur OpenAIRE .

Livrables

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

Creation and curation of a DMP as prerequisite for taking part in the ORD pilot.

Publications

Peer reviewed articles (18)

Active state structures of a bistable visual opsin bound to G proteins

Auteurs: Oliver Tejero, Filip Pamula, Mitsumasa Koyanagi, Takashi Nagata, Pavel Afanasyev, Ishita Das, Xavier Deupi, Mordechai Sheves, Akihisa Terakita, Gebhard F. X. Schertler, Matthew J. Rodrigues, Ching-Ju Tsai
Publié dans: Nature Communications, Numéro 15, 2024, ISSN 2041-1723
Éditeur: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53208-2

Retinal to Retinal Energy Transfer in a Bistable Microbial Rhodopsin Dimer

Auteurs: Ivo H. M. van Stokkum, Jakub Dostal, Thanh Nhut Do, Lifei Fu, Gregor Madej, Christine Ziegler, Peter Hegemann, Miroslav Kloz, Matthias Broser, John T. M. Kennis
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 147, 2025, Page(s) 14468-14480, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.5c01276

Beyond Lux: methods for species and photoreceptor-specific quantification of ambient light for mammals

Auteurs: Richard J. McDowell, Altug Didikoglu, Tom Woelders, Mazie J. Gatt, Finn Moffatt, Saba Notash, Roelof A. Hut, Timothy M. Brown, Robert J. Lucas
Publié dans: BMC Biology, Numéro 22, 2024, ISSN 1741-7007
Éditeur: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-024-02038-1

Spectral Tuning in Mammalian Melanopsins

Auteurs: Richard J McDowell, Mazie J Gatt, Saba Notash, Robert J Lucas
Publié dans: Molecular Biology and Evolution, Numéro 42, 2025, ISSN 0737-4038
Éditeur: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msaf158

Light-induced FTIR Spectroscopy of Visual Rhodopsin Microcrystals Grown in Lipidic Cubic Phase

Auteurs: Yosuke Mizuno, Valérie Panneels, Yuji Furutani, Gebhard F.X. Schertler, Hideki Kandori, Kota Katayama
Publié dans: Journal of Molecular Biology, Numéro 437, 2025, Page(s) 169487, ISSN 0022-2836
Éditeur: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2025.169487

Activating an invertebrate bistable opsin with the all-trans 6.11 retinal analog

Auteurs: Matthew J. Rodrigues, Oliver Tejero, Jonas Mühle, Filip Pamula, Ishita Das, Ching-Ju Tsai, Akihisa Terakita, Mordechai Sheves, Gebhard F. X. Schertler
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 121, 2024, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2406814121

Study of Photoselectivity in Linear Conjugated Chromophores Using the XMS-CASPT2 Method

Auteurs: Saumik Sen, Xavier Deupi
Publié dans: ACS Physical Chemistry Au, 2024, ISSN 2694-2445
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsphyschemau.4c00065

Development of visible light‐sensitive human neuropsin (<scp>OPN5</scp>) via single amino acid substitution

Auteurs: Yusuke Sakai, Richard J. McDowell, Robert J. Lucas
Publié dans: FEBS Letters, Numéro 599, 2025, Page(s) 2612-2619, ISSN 0014-5793
Éditeur: Elsevier BV
DOI: 10.1002/1873-3468.70130

A multiscale screening platform for rapid GPCR variant profiling reveals color-tuned JSR1 mutants

Auteurs: Jonas Mühle, Deborah Walter, Marielouise Griebl, Gebhard F.X. Schertler
Publié dans: Biophysical Journal, 2025, ISSN 0006-3495
Éditeur: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2025.10.034

Optogenetic interrogation of cell signalling: human neuropsin (hOPN5) represents a potent tool for controlling the Gq pathway with light

Auteurs: Siri, Leemann; Sonja, Kleinlogel; Franziska, Schneider-Warme
Publié dans: Pflügers Archiv - European Journal of Physiology, Numéro Volume 474, 2022, Page(s) 1217–1219, ISSN 0031-6768
Éditeur: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00424-022-02765-w

Tool antibody fragments reveal multiple conformations of the rhodopsin-Gi signaling complex

Auteurs: Filip Pamula, Oliver Tejero, Jonas Mühle, Ralf Thoma, Gebhard F.X. Schertler, Jacopo Marino, Ching-Ju Tsai
Publié dans: Biophysical Journal, 2025, ISSN 0006-3495
Éditeur: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2025.09.044

Structural Insights Into the Opening Mechanism of C1C2 Channelrhodopsin

Auteurs: Matthias Mulder, Songhwan Hwang, Matthias Broser, Steffen Brünle, Petr Skopintsev, Caspar Schattenberg, Christina Schnick, Sina Hartmann, Jonathan Church, Igor Schapiro, Florian Dworkowski, Tobias Weinert, Peter Hegemann, Han Sun, Jörg Standfuss
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 147, 2025, Page(s) 1282-1290, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.4c15402

Ultrafast terahertz Stark spectroscopy reveals the excited-state dipole moments of retinal in bacteriorhodopsin

Auteurs: Jia Zhang, Poonam Singh, Dieter Engel, Benjamin P. Fingerhut, Matthias Broser, Peter Hegemann, Thomas Elsaesser
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 121, 2024, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2319676121

Multiple retinal isomerizations during the early phase of the bestrhodopsin photoreaction

Auteurs: Spyridon Kaziannis, Matthias Broser, Ivo H. M. van Stokkum, Jakub Dostal, Wayne Busse, Arno Munhoven, Cesar Bernardo, Miroslav Kloz, Peter Hegemann, John T. M. Kennis
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro 121, 2024, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2318996121

Experimental Assessment of the Electronic and Geometrical Structure of a Near-Infrared Absorbing and Highly Fluorescent Microbial Rhodopsin

Auteurs: Matthias Broser, Tadeusz Andruniów, Anastasia Kraskov, Riccardo Palombo, Sagie Katz, Miroslav Kloz, Jakub Dostál, César Bernardo, John T. M. Kennis, Peter Hegemann, Massimo Olivucci, Peter Hildebrandt
Publié dans: The Journal of Physical Chemistry Letters, Numéro 14, 2023, Page(s) 9291-9295, ISSN 1948-7185
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c02167

Diversity of rhodopsin cyclases in zoospore-forming fungi

Auteurs: Matthias Broser; Wayne Busse; Anika Spreen; Maila Reh; Yinth Andrea Bernal Sierra; Songhwan Hwang; Tillmann Utesch; Han Sun; Peter Hegemann
Publié dans: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numéro Vol. 120 | No. 44, 2023, ISSN 0027-8424
Éditeur: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2310600120

Graph-based algorithms to dissect long-distancewater-mediated H-bond networks for conformationalcouplings in GPCRs

Auteurs: Eva Bertalan, Matthew Joseph Rodrigues, Gebhard F. X. Schertler, Ana-Nicoleta Bondar
Publié dans: British Journal of Pharmacology, 2024, ISSN 0007-1188
Éditeur: Wiley-Blackwell
DOI: 10.1111/bph.16387

Multistep 11-<i>cis</i> to All-<i>trans</i> Retinal Photoisomerization in Bestrhodopsin, an Unusual Microbial Rhodopsin

Auteurs: Matthias Broser, Spyridon Kaziannis, Ivo H.M. van Stokkum, Atripan Mukherjee, Jakub Dostal, Wayne Busse, Arno Munhoven, Cesar Bernardo, Peter Hegemann, Miroslav Kloz, John T.M. Kennis
Publié dans: Journal of the American Chemical Society, Numéro 147, 2025, Page(s) 25571-25583, ISSN 0002-7863
Éditeur: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.5c06216

Other (3)

Development of visible light-sensitive human OPN5 via single amino acid substitution

Auteurs: Yusuke Sakai, Richard J. McDowell, Robert J. Lucas
Publié dans: bioRxiv, 2025
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.05.19.654910

Active state structures of a bistable visual opsin bound to G1proteins

Auteurs: Oliver Tejero, Filip Pamula, Mitsumasa Koyanagi, Takashi Nagata, Pavel Afanasyev, Ishita Das, Xavier Deupi, Mordechai Sheves, Akihisa Terakita, Gebhard F.X. Schertler, Matthew J. Rodrigues, Ching-Ju Tsai
Publié dans: bioRxiv, 2024
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.04.09.588704

Beyond Lux: Methods for Species and Photoreceptor-Specific Quantification of Ambient Light for Mammals

Auteurs: Richard J McDowell, Altug Didikoglu, Tom Woelders, Mazie J Gatt, Roelof A Hut, Timothy M Brown, Robert J Lucas
Publié dans: bioRxiv, 2023
Éditeur: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.08.25.554794