Switchable rhodOpsins in Life Sciences

Informazioni relative al progetto

SOL

ID dell’accordo di sovvenzione: 951644

DOI

10.3030/951644

Data della firma CE 7 Febbraio 2021

Data di avvio 1 Settembre 2022

Data di completamento 31 Agosto 2028

Finanziato da

• EXCELLENT SCIENCE - European Research Council (ERC)

Costo totale

€ 7 971 388,75

Contributo UE

€ 7 971 388,75

Coordinato da

PAUL SCHERRER INSTITUT
Switzerland

CORDIS fornisce collegamenti ai risultati finali pubblici e alle pubblicazioni dei progetti ORIZZONTE.

I link ai risultati e alle pubblicazioni dei progetti del 7° PQ, così come i link ad alcuni tipi di risultati specifici come dataset e software, sono recuperati dinamicamente da .OpenAIRE .

Risultati finali

Open Research Data Pilot (1)

Data Management Plan (DMP)

Creation and curation of a DMP as prerequisite for taking part in the ORD pilot.

Pubblicazioni

Peer reviewed articles (18)

Active state structures of a bistable visual opsin bound to G proteins

Autori: Oliver Tejero, Filip Pamula, Mitsumasa Koyanagi, Takashi Nagata, Pavel Afanasyev, Ishita Das, Xavier Deupi, Mordechai Sheves, Akihisa Terakita, Gebhard F. X. Schertler, Matthew J. Rodrigues, Ching-Ju Tsai
Pubblicato in: Nature Communications, Numero 15, 2024, ISSN 2041-1723
Editore: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41467-024-53208-2

Retinal to Retinal Energy Transfer in a Bistable Microbial Rhodopsin Dimer

Autori: Ivo H. M. van Stokkum, Jakub Dostal, Thanh Nhut Do, Lifei Fu, Gregor Madej, Christine Ziegler, Peter Hegemann, Miroslav Kloz, Matthias Broser, John T. M. Kennis
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 147, 2025, Pagina/e 14468-14480, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.5c01276

Beyond Lux: methods for species and photoreceptor-specific quantification of ambient light for mammals

Autori: Richard J. McDowell, Altug Didikoglu, Tom Woelders, Mazie J. Gatt, Finn Moffatt, Saba Notash, Roelof A. Hut, Timothy M. Brown, Robert J. Lucas
Pubblicato in: BMC Biology, Numero 22, 2024, ISSN 1741-7007
Editore: BioMed Central
DOI: 10.1186/s12915-024-02038-1

Spectral Tuning in Mammalian Melanopsins

Autori: Richard J McDowell, Mazie J Gatt, Saba Notash, Robert J Lucas
Pubblicato in: Molecular Biology and Evolution, Numero 42, 2025, ISSN 0737-4038
Editore: Oxford University Press
DOI: 10.1093/molbev/msaf158

Light-induced FTIR Spectroscopy of Visual Rhodopsin Microcrystals Grown in Lipidic Cubic Phase

Autori: Yosuke Mizuno, Valérie Panneels, Yuji Furutani, Gebhard F.X. Schertler, Hideki Kandori, Kota Katayama
Pubblicato in: Journal of Molecular Biology, Numero 437, 2025, Pagina/e 169487, ISSN 0022-2836
Editore: Academic Press
DOI: 10.1016/j.jmb.2025.169487

Activating an invertebrate bistable opsin with the all-trans 6.11 retinal analog

Autori: Matthew J. Rodrigues, Oliver Tejero, Jonas Mühle, Filip Pamula, Ishita Das, Ching-Ju Tsai, Akihisa Terakita, Mordechai Sheves, Gebhard F. X. Schertler
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 121, 2024, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2406814121

Study of Photoselectivity in Linear Conjugated Chromophores Using the XMS-CASPT2 Method

Autori: Saumik Sen, Xavier Deupi
Pubblicato in: ACS Physical Chemistry Au, 2024, ISSN 2694-2445
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acsphyschemau.4c00065

Development of visible light‐sensitive human neuropsin (<scp>OPN5</scp>) via single amino acid substitution

Autori: Yusuke Sakai, Richard J. McDowell, Robert J. Lucas
Pubblicato in: FEBS Letters, Numero 599, 2025, Pagina/e 2612-2619, ISSN 0014-5793
Editore: Elsevier BV
DOI: 10.1002/1873-3468.70130

A multiscale screening platform for rapid GPCR variant profiling reveals color-tuned JSR1 mutants

Autori: Jonas Mühle, Deborah Walter, Marielouise Griebl, Gebhard F.X. Schertler
Pubblicato in: Biophysical Journal, 2025, ISSN 0006-3495
Editore: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2025.10.034

Optogenetic interrogation of cell signalling: human neuropsin (hOPN5) represents a potent tool for controlling the Gq pathway with light

Autori: Siri, Leemann; Sonja, Kleinlogel; Franziska, Schneider-Warme
Pubblicato in: Pflügers Archiv - European Journal of Physiology, Numero Volume 474, 2022, Pagina/e 1217–1219, ISSN 0031-6768
Editore: Springer Verlag
DOI: 10.1007/s00424-022-02765-w

Tool antibody fragments reveal multiple conformations of the rhodopsin-Gi signaling complex

Autori: Filip Pamula, Oliver Tejero, Jonas Mühle, Ralf Thoma, Gebhard F.X. Schertler, Jacopo Marino, Ching-Ju Tsai
Pubblicato in: Biophysical Journal, 2025, ISSN 0006-3495
Editore: Biophysical Society
DOI: 10.1016/j.bpj.2025.09.044

Structural Insights Into the Opening Mechanism of C1C2 Channelrhodopsin

Autori: Matthias Mulder, Songhwan Hwang, Matthias Broser, Steffen Brünle, Petr Skopintsev, Caspar Schattenberg, Christina Schnick, Sina Hartmann, Jonathan Church, Igor Schapiro, Florian Dworkowski, Tobias Weinert, Peter Hegemann, Han Sun, Jörg Standfuss
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 147, 2025, Pagina/e 1282-1290, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.4c15402

Ultrafast terahertz Stark spectroscopy reveals the excited-state dipole moments of retinal in bacteriorhodopsin

Autori: Jia Zhang, Poonam Singh, Dieter Engel, Benjamin P. Fingerhut, Matthias Broser, Peter Hegemann, Thomas Elsaesser
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 121, 2024, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2319676121

Multiple retinal isomerizations during the early phase of the bestrhodopsin photoreaction

Autori: Spyridon Kaziannis, Matthias Broser, Ivo H. M. van Stokkum, Jakub Dostal, Wayne Busse, Arno Munhoven, Cesar Bernardo, Miroslav Kloz, Peter Hegemann, John T. M. Kennis
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero 121, 2024, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2318996121

Experimental Assessment of the Electronic and Geometrical Structure of a Near-Infrared Absorbing and Highly Fluorescent Microbial Rhodopsin

Autori: Matthias Broser, Tadeusz Andruniów, Anastasia Kraskov, Riccardo Palombo, Sagie Katz, Miroslav Kloz, Jakub Dostál, César Bernardo, John T. M. Kennis, Peter Hegemann, Massimo Olivucci, Peter Hildebrandt
Pubblicato in: The Journal of Physical Chemistry Letters, Numero 14, 2023, Pagina/e 9291-9295, ISSN 1948-7185
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/acs.jpclett.3c02167

Diversity of rhodopsin cyclases in zoospore-forming fungi

Autori: Matthias Broser; Wayne Busse; Anika Spreen; Maila Reh; Yinth Andrea Bernal Sierra; Songhwan Hwang; Tillmann Utesch; Han Sun; Peter Hegemann
Pubblicato in: Proceedings of the National Academy of Sciences, Numero Vol. 120 | No. 44, 2023, ISSN 0027-8424
Editore: National Academy of Sciences
DOI: 10.1073/pnas.2310600120

Graph-based algorithms to dissect long-distancewater-mediated H-bond networks for conformationalcouplings in GPCRs

Autori: Eva Bertalan, Matthew Joseph Rodrigues, Gebhard F. X. Schertler, Ana-Nicoleta Bondar
Pubblicato in: British Journal of Pharmacology, 2024, ISSN 0007-1188
Editore: Wiley-Blackwell
DOI: 10.1111/bph.16387

Multistep 11-<i>cis</i> to All-<i>trans</i> Retinal Photoisomerization in Bestrhodopsin, an Unusual Microbial Rhodopsin

Autori: Matthias Broser, Spyridon Kaziannis, Ivo H.M. van Stokkum, Atripan Mukherjee, Jakub Dostal, Wayne Busse, Arno Munhoven, Cesar Bernardo, Peter Hegemann, Miroslav Kloz, John T.M. Kennis
Pubblicato in: Journal of the American Chemical Society, Numero 147, 2025, Pagina/e 25571-25583, ISSN 0002-7863
Editore: American Chemical Society
DOI: 10.1021/jacs.5c06216

Other (3)

Development of visible light-sensitive human OPN5 via single amino acid substitution

Autori: Yusuke Sakai, Richard J. McDowell, Robert J. Lucas
Pubblicato in: bioRxiv, 2025
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2025.05.19.654910

Active state structures of a bistable visual opsin bound to G1proteins

Autori: Oliver Tejero, Filip Pamula, Mitsumasa Koyanagi, Takashi Nagata, Pavel Afanasyev, Ishita Das, Xavier Deupi, Mordechai Sheves, Akihisa Terakita, Gebhard F.X. Schertler, Matthew J. Rodrigues, Ching-Ju Tsai
Pubblicato in: bioRxiv, 2024
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2024.04.09.588704

Beyond Lux: Methods for Species and Photoreceptor-Specific Quantification of Ambient Light for Mammals

Autori: Richard J McDowell, Altug Didikoglu, Tom Woelders, Mazie J Gatt, Roelof A Hut, Timothy M Brown, Robert J Lucas
Pubblicato in: bioRxiv, 2023
Editore: Cold Spring Harbor Laboratory
DOI: 10.1101/2023.08.25.554794