Description du projet
De la séquence aux représentations basées sur des graphes – un changement de paradigme en génomique
Le séquençage du génome vise à déterminer l’ordre des As, Cs, Gs et Ts, qui représentent les nucléotides de l’ADN dans le génome d’un organisme. Les avancées en la matière ont engendré un volume de données en constante augmentation dans le monde entier. Financé par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet ALPACA développera des représentations de génomes basées sur les graphes qui s’appuient sur la combinaison des variations individuelles d’une manière significative du point de vue de l’évolution. Cela permettra de traiter et d’analyser les données de séquençage de manière plus efficace par rapport aux approches traditionnelles, qui sont basées sur des représentations ordinaires de génomes de type séquentiel. Ce changement de paradigme jouera un rôle essentiel dans la médecine personnalisée et l’analyse des agents pathogènes.
Champ scientifique
Programme(s)
Régime de financement
MSCA-ITN - Marie Skłodowska-Curie Innovative Training Networks (ITN)
Coordinateur
33615 Bielefeld
Allemagne
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Participants (12)
75794 Paris
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78153 Le Chesnay Cedex
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56126 Pisa
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20126 Milano
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3526 KV Utrecht
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40225 Dusseldorf
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69117 Heidelberg
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814 99 Bratislava
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00014 Helsingin Yliopisto
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75724 Paris Cedex 15
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CB2 1TN Cambridge
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841 04 Bratislava
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L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.