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ALgorithms for PAngenome Computational Analysis

Description du projet

De la séquence aux représentations basées sur des graphes – un changement de paradigme en génomique

Le séquençage du génome vise à déterminer l’ordre des As, Cs, Gs et Ts, qui représentent les nucléotides de l’ADN dans le génome d’un organisme. Les avancées en la matière ont engendré un volume de données en constante augmentation dans le monde entier. Financé par le programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet ALPACA développera des représentations de génomes basées sur les graphes qui s’appuient sur la combinaison des variations individuelles d’une manière significative du point de vue de l’évolution. Cela permettra de traiter et d’analyser les données de séquençage de manière plus efficace par rapport aux approches traditionnelles, qui sont basées sur des représentations ordinaires de génomes de type séquentiel. Ce changement de paradigme jouera un rôle essentiel dans la médecine personnalisée et l’analyse des agents pathogènes.

Coordinateur

UNIVERSITAET BIELEFELD
Contribution nette de l'UE
€ 505 576,80
Adresse
Universitaetsstrasse 25
33615 Bielefeld
Allemagne

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Région
Nordrhein-Westfalen Detmold Bielefeld, Kreisfreie Stadt
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Contribution hors UE
€ 0,00

Participants (12)

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
France
Contribution nette de l'UE
€ 274 802,04
Adresse
Rue Michel Ange 3
75794 Paris

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Région
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Type d’activité
Research Organisations
Contribution hors UE
€ 0,00
INSTITUT NATIONAL DE RECHERCHE EN INFORMATIQUE ET AUTOMATIQUE
France
Contribution nette de l'UE
€ 274 802,04
Adresse
Domaine De Voluceau Rocquencourt
78153 Le Chesnay Cedex

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Région
Ile-de-France Ile-de-France Yvelines
Type d’activité
Research Organisations
Contribution hors UE
€ 0,00
UNIVERSITA DI PISA
Italie
Contribution nette de l'UE
€ 261 499,68
Adresse
Lungarno Pacinotti 43/44
56126 Pisa

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Région
Centro (IT) Toscana Pisa
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Contribution hors UE
€ 0,00
UNIVERSITA' DEGLI STUDI DI MILANO-BICOCCA
Italie
Contribution nette de l'UE
€ 261 499,68
Adresse
Piazza Dell'ateneo Nuovo 1
20126 Milano

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Région
Nord-Ovest Lombardia Milano
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Contribution hors UE
€ 0,00
STICHTING NEDERLANDSE WETENSCHAPPELIJK ONDERZOEK INSTITUTEN
Pays-Bas
Contribution nette de l'UE
€ 265 619,88
Adresse
Winthontlaan 2
3526 KV Utrecht

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Région
West-Nederland Utrecht Utrecht
Type d’activité
Research Organisations
Contribution hors UE
€ 0,00
HEINRICH-HEINE-UNIVERSITAET DUESSELDORF
Allemagne
Contribution nette de l'UE
€ 252 788,40
Adresse
Universitaetsstrasse 1
40225 Dusseldorf

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Région
Nordrhein-Westfalen Düsseldorf Düsseldorf, Kreisfreie Stadt
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Contribution hors UE
€ 0,00
EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Allemagne
Contribution nette de l'UE
€ 303 172,56
Adresse
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg

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Région
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Type d’activité
Research Organisations
Contribution hors UE
€ 0,00
UNIVERZITA KOMENSKEHO V BRATISLAVE
Slovaquie
Contribution nette de l'UE
€ 233 246,88
Adresse
Safarikovo Nam 6
814 99 Bratislava

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Région
Slovensko Bratislavský kraj Bratislavský kraj
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Contribution hors UE
€ 0,00
HELSINGIN YLIOPISTO
Finlande
Contribution nette de l'UE
€ 280 805,76
Adresse
Yliopistonkatu 3
00014 Helsingin Yliopisto

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Région
Manner-Suomi Helsinki-Uusimaa Helsinki-Uusimaa
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Contribution hors UE
€ 0,00
INSTITUT PASTEUR
France
Contribution nette de l'UE
€ 274 802,04
Adresse
Rue Du Docteur Roux 25-28
75724 Paris Cedex 15

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Région
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Type d’activité
Research Organisations
Contribution hors UE
€ 0,00
THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
United Kingdom
Contribution nette de l'UE
€ 303 172,56
Adresse
Trinity Lane The Old Schools
CB2 1TN Cambridge

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Région
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Contribution hors UE
€ 0,00
GENETON S.R.O.
Slovaquie
Contribution nette de l'UE
€ 233 246,88
Adresse
Ilkovicova 8
841 04 Bratislava

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PME

L’entreprise s’est définie comme une PME (petite et moyenne entreprise) au moment de la signature de la convention de subvention.

Oui
Région
Slovensko Bratislavský kraj Bratislavský kraj
Type d’activité
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Contribution hors UE
€ 0,00