Biocatalytic upgrading of natural biopolymers for reassembly as multipurpose materials

Información del proyecto

BioUPGRADE

Identificador del acuerdo de subvención: 964764

DOI

10.3030/964764

Proyecto cerrado

Fecha de la firma de la CE 19 Enero 2021

Fecha de inicio 1 Mayo 2021

Fecha de finalización 31 Octubre 2025

Financiado con arreglo a

• EXCELLENT SCIENCE - Future and Emerging Technologies (FET)

Coste total

€ 2 992 140,00

Aportación de la UE

€ 2 992 140,00

Coordinado por

AALTO KORKEAKOULUSAATIO SR
Finland

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Publicaciones

Peer reviewed articles (17)

Unraveling the unique structural motifs of glucuronoxylan from hybrid aspen wood

Autores: Pramod Sivan, Emilia Heinonen, Louis Escudero, Madhavi Latha Gandla, Amparo Jiménez-Quero, Leif J. Jönsson, Ewa J. Mellerowicz, Francisco Vilaplana
Publicado en: Carbohydrate Polymers, Edición 343, 2024, Página(s) 122434, ISSN 0144-8617
Editor: Pergamon Press Ltd.
DOI: 10.1016/j.carbpol.2024.122434

Comparative assessment of chemical and biochemical approaches for the activation of lignocellulosic materials and emerging opportunities for expansin-related proteins

Autores: Salla Hiltunen, Janak Sapkota, Eleni Ioannou, Majid Haddad Momeni, Emma Master, Matti Ristolainen
Publicado en: Cellulose, Edición 31, 2024, Página(s) 147-168, ISSN 0969-0239
Editor: Blackie Academic & Professional
DOI: 10.1007/s10570-023-05637-3

Enzymatic Routes to Designer Hemicelluloses for Use in Biobased Materials

Autores: Thu V. Vuong, Mohammad Aghajohari, Xuebin Feng, Amanda K. Woodstock, Deepti M. Nambiar, Zeina C. Sleiman, Breeanna R. Urbanowicz, Emma R. Master
Publicado en: JACS Au, Edición 4, 2024, Página(s) 4044-4065, ISSN 2691-3704
Editor: American Chemical Society (ACS)
DOI: 10.1021/jacsau.4c00469

Carbohydrate-binding domain CBM63 of microbial expansin-like BsEXLX1 facilitates the adsorption of expansin-related proteins to hemicelluloses in plant secondary cell walls

Autores: Pramod Sivan, Deepika Dahiya, Ylenia Jabalera, Taru Koitto, Raul Perez-Jimenez, Ewa J. Mellerowicz, Emma Master, Francisco Vilaplana
Publicado en: Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, Edición 18, 2025, ISSN 2731-3654
Editor: BioMed Central Ltd.
DOI: 10.1186/s13068-025-02674-x

Insights into the action of phylogenetically diverse microbial expansins on the structure of cellulose microfibrils

Autores: Majid Haddad Momeni, Aleksi Zitting, Vilma Jäämuru, Rosaliina Turunen, Paavo Penttilä, Garry W. Buchko, Salla Hiltunen, Natalia Maiorova, Anu Koivula, Janak Sapkota, Kaisa Marjamaa, Emma R. Master
Publicado en: Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, Edición 17, 2024, ISSN 2731-3654
Editor: BioMed Central Ltd.
DOI: 10.1186/s13068-024-02500-w

A resurrected ancestor of Cas12a expands target access and substrate recognition for nucleic acid editing and detection

Autores: Ylenia Jabalera, Igor Tascón, Sara Samperio, Jorge P. López-Alonso, Monika Gonzalez-Lopez, Ana M. Aransay, Guillermo Abascal-Palacios, Chase L. Beisel, Iban Ubarretxena-Belandia, Raul Perez-Jimenez
Publicado en: Nature Biotechnology, Edición 43, 2025, Página(s) 1663-1672, ISSN 1087-0156
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41587-024-02461-3

Enzymatic upgrading of nanochitin using an ancient lytic polysaccharide monooxygenase

Autores: Leire Barandiaran, Borja Alonso-Lerma, Antonio Reifs, Izaskun Larraza, Raquel Olmos-Juste, Alba Fernandez-Calvo, Ylenia Jabalera, Arantxa Eceiza, Raul Perez-Jimenez
Publicado en: Communications Materials, Edición 3, 2022, ISSN 2662-4443
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1038/s43246-022-00277-9

Sustainable Cellulose‐Based Coatings and Their Impact on Mechanical and Barrier Properties of Paper

Autores: Salla Hiltunen, Wilma Heinola, Janak Sapkota
Publicado en: Macromolecular Materials and Engineering, Edición 310, 2025, ISSN 1438-7492
Editor: John Wiley & Sons Ltd.
DOI: 10.1002/mame.202500184

Fungal loosenin-like proteins boost the cellulolytic enzyme conversion of pretreated wood fiber and cellulosic pulps

Autores: Deepika Dahiya, Taru Koitto, Kim Kutvonen, Yan Wang, Majid Haddad Momeni, Siiri de Ruijter, Emma R. Master
Publicado en: Bioresource Technology, Edición 394, 2025, Página(s) 130188, ISSN 0960-8524
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.biortech.2023.130188

Sequential extraction of hemicelluloses by subcritical water improves saccharification of hybrid aspen wood grown in greenhouse and field conditions

Autores: Pramod Sivan, Emilia Heinonen, Madhavi Latha Gandla, Amparo Jiménez-Quero, Hüsamettin Deniz Özeren, Leif J. Jönsson, Ewa J. Mellerowicz, Francisco Vilaplana
Publicado en: Green Chemistry, Edición 14/25, 2023, Página(s) 5634-5646, ISSN 1757-7039
Editor: Royal Society of Chemistry
DOI: 10.1039/d3gc01020a

Uncovering Sequence and Structural Characteristics of Fungal Expansin‐Related Proteins With Potential to Drive Substrate Targeting

Autores: Anna Pohto, Taru Koitto, Deepika Dahiya, Alessandra Castro, Elizaveta Sidorova, Martina Huusela, Scott E. Baker, Adrian Tsang, Emma Master
Publicado en: Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 2025, ISSN 0887-3585
Editor: Wiley-Liss Inc
DOI: 10.1002/prot.70029

SANS investigation of fungal loosenins reveals substrate-dependent impacts of protein action on the inter-microfibril arrangement of cellulosic substrates

Autores: Deepika Dahiya, Zsuzsanna Péter-Szabó, Manjula Senanayake, Sai Venkatesh Pingali, Wellington C. Leite, James Byrnes, Garry W. Buchko, Pramod Sivan, Francisco Vilaplana, Emma R. Master, Hugh O’Neill
Publicado en: Biotechnology for Biofuels and Bioproducts, Edición 18, 2025, ISSN 2731-3654
Editor: BioMed Central Ltd.
DOI: 10.1186/s13068-025-02618-5

Effects of sequential ball milling and loosenin-like protein treatment on pulp fibers

Autores: Salla Hiltunen, Deepika Dahiya, Martina Huusela, Emma Master, Matti Ristolainen, Janak Sapkota
Publicado en: Industrial Crops and Products, Edición 237, 2025, Página(s) 122177, ISSN 0926-6690
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.indcrop.2025.122177

Compliant mechanical response of the ultrafast folding protein EnHD under force

Autores: Antonio Reifs, Irene Ruiz Ortiz, Amaia Ochandorena Saa, Jörg Schönfelder, David De Sancho, Victor Muñoz, Raul Perez-Jimenez
Publicado en: Communications Physics, Edición 6, 2023, ISSN 2399-3650
Editor: Springer Nature
DOI: 10.1038/s42005-022-01125-5

Evolution of CRISPR-associated endonucleases as inferred from resurrected proteins

Autores: Borja Alonso-Lerma, Ylenia Jabalera, Sara Samperio, Matias Morin, Almudena Fernandez, Logan T. Hille, Rachel A. Silverstein, Ane Quesada-Ganuza, Antonio Reifs, Sergio Fernández-Peñalver, Yolanda Benitez, Lucia Soletto, Jose A. Gavira, Adrian Diaz, Wim Vranken, Avencia Sanchez-Mejias, Marc Güell, Francisco J. M. Mojica, Benjamin P. Kleinstiver, Miguel A. Moreno-Pelayo, Lluis Montoliu, Raul Perez
Publicado en: Nature Microbiology, Edición 8/1, 2023, Página(s) 77–90, ISSN 2058-5276
Editor: Nature Publishing Group
DOI: 10.1038/s41564-022-01265-y

Loosenin-Like Proteins from Phanerochaete carnosa Impact Both Cellulose and Chitin Fiber Networks

Autores: Mareike Monschein, Eleni Ioannou, Taru Koitto, Leamon A. K. M. Al Amin, Jutta J. Varis, Edward R. Wagner, Kirsi S. Mikkonen, Daniel J. Cosgrove, Emma R. Master
Publicado en: Applied and Environmental Microbiology, Edición 89/1, 2023, ISSN 0099-2240
Editor: American Society for Microbiology
DOI: 10.1128/aem.01863-22

Phylogenetically distinct fungal expansins show different binding preferences towards cellulosic materials and enhance cellulase activity

Autores: Taru Koitto, Deepika Dahiya, Martina Huusela, Merja Penttilä, Emma Master
Publicado en: Current Research in Biotechnology, Edición 9, 2025, Página(s) 100296, ISSN 2590-2628
Editor: Elsevier BV
DOI: 10.1016/j.crbiot.2025.100296

Other (1)

BioUPGRADE: Advancing biocatalysts to enrich the global bioeconomy

Autores: Emma R. Master, Raul Perez Jimenez, Francisco Vilaplana, Janak Sapkota, Salla Hiltunen
Publicado en: The Innovation Platform, Edición Edición 15, 2023, Página(s) 274-275, ISSN 2634-0208
Editor: Innovation News Network

Conference proceedings (1)

Microbial Expansin Related Proteins for Improved Enzymatic Action for Conversion of Lignocellulose to Platform Sugars

Autores: Deepika Dahiya, Siiri de Ruijter, Kim Kutvonen, Emma Master, Amy Yan Wang
Publicado en: NWBC 2022: The 10th Nordic Wood Biorefinery Conference, 2022, Página(s) 220-221, ISBN 978-951-38-8772-8
Editor: VTT Technical Research Centre of Finland
DOI: 10.32040/2242-122x.2022.t409

Derechos de propiedad intelectual

Patent (4)

METHOD FOR THE PRODUCTION OF A CONDUCTIVE GRAPHENE-BASED INK AND PRODUCT THEREOF

Número de solicitud/publicación: 22 382482
Fecha: 2022-05-19
Solicitante(s): ASOCIACION CENTRO DE INVESTIGACION COOPERATIVA EN NANOCIENCIAS CIC NANOGUNE

METHOD FOR PRODUCING CRYSTALLINE NANOCELLULOSE

Número de solicitud/publicación: 21 707689
Fecha: 2021-02-26
Solicitante(s): ASOCIACION CENTRO DE INVESTIGACION COOPERATIVA EN NANOCIENCIAS CIC NANOGUNE

SYNTHETIC CAS PROTEINS

Número de solicitud/publicación: 20 24076114
Fecha: 2024-09-18
Solicitante(s): ASOCIACION CENTRO DE INVESTIGACION COOPERATIVA EN BIOCIENCIAS

USE OF LYTIC POLYSACCHARIDE MONOOXYGENASES, ENZYMATIC COMPOSITION CONTAINING SAME, AND DEGRADATION METHOD FOR PLASTIC POLYMERS

Número de solicitud/publicación: 21 807602
Fecha: 2021-05-17
Solicitante(s): ASOCIACION CENTRO DE INVESTIGACION COOPERATIVA EN NANOCIENCIAS CIC NANOGUNE