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Contenuto archiviato il 2024-04-30

Transposable elements and biodiversity in crop plant species

Obiettivo



Biodiversity is the result of mutations of genomes. A major source of mutation in plants is the mobilization of transposable genetic elements. Transposable elements exist in all plant genomes; often comprising several percents of the total DNA content.
Additionally, copy numbers of particular transposable elements per genome can fluctuate by several orders of magnitude over time scales of a few MYr. Transposable elements are therefore a major contributor (and perhaps THE major contributor) to the generation of genetic biodiversity in plants. Despite this, very little study of the amount of biodiversity caused by transposable elements in plants has yet been attempted. The first goal of this proposal is to measure the genetic biodiversity generated by class I transposable elements (the major plant transposable element family) in several of the most agronomically important crop species to the EEC (Objectives/Work Packages 1-2). Our second goal is to develop class I transposable elements as molecular markers to measure biodiversity and phylogenetic relationships in crop species and their wild relatives (Objectives/ Work Packages 3-5). Certain class I transposable elements should be an excellent source of useful polymorphic markers for genome characterization because they are one of the most mutable components of plant genomes (Objective/Work Packages 4 and 5). Other class I elements are potentially very useful for phylogenetic analysis because they transpose at rates which are similar to speciation rates (Objective/Work Packages 3 and 5).
A large fraction of the worldwide research on plant class I transposable elements has been performed by EC laboratories. Collectively our expertise covers a significant fraction of the well characterised plant class I TEs. The proposed project will bring our laboratories together to tackle shared problem sand address shared goals. The collaborative research proposed here will result in a quantum leap in the efficiency and speed of our individual programs and maintain the lead which Europe holds in this exciting research area.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

Dati non disponibili

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

CSC - Cost-sharing contracts

Coordinatore

UNIVERSITY OF DUNDEE
Contributo UE
Nessun dato
Indirizzo
MSI/WTB Complex Dow Street
DD1 4HN DUNDEE
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (6)

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