Ziel
"Two-component" regulatory systems and sigma54-dependent transcription control many aspects of bacterial metabolism of medical, agronomic, and biotechnological importance. Structural information would greatly enhance our understanding of these control mechanisms and our ability to manipulate them. We propose to use X-ray crystallography to determine high-resolution structures of 7 proteins involved in such systems; the rhizobial FixLJ proteins, the NtrBC and NifLA proteins, and sigma54 itself. NtrC and NifA are sigma54 dependent transcriptional activators, and our ultimate objective is to generate dynamic models of these sensory transduction pathways from sensory input to transcriptional initiation.
NMR will be used principally to characterise various conformational changes involved in sensory transduction, namely i) changes in NifL resulting from nucleotide binding or oxidation of FAD that affect its interaction with NifA, information that we wish to relate to the overall form of the NifL:NifA complex, and ii) changes in conformation of the receiver domains of NtrC and FixJ resulting from phosphorylation.
We further wish to determine the structure of interfaces between pairs of sensory transduction proteins and within the activated sigma54 based transcription complex. Where proteins form stable complexes (eg the NifL:NifA pair) we will attempt to crystallise these to obtain such information directly. In other cases X-ray and neutron scattering of biochemically stabilised complex will be used to provide envelope structures into which high-resolution models o constituent proteins can be incorporated using software developed within the partnership, an approach to structure determination we intend to develop further to cope with the sigma54-based transcription complex. Solution scattering techniques will also be used to determine the quaternary structure of the oligomeric forms of NtrC, NifA and FixJ which are the transcriptionally active species.
Structural information will be used in the rational design of chimeric sensory transduction proteins which allow one regulatory system to be subjected to the sensory inputs of another. If successful this will pave the way to manipulating the expression of entire metabolic pathways in response to chosen environmental stimuli; we identify potential industrial applications. Molecular biological approaches will, in addition, identify protein interfaces to assist modelling of complexes, seek to stabiliseable entities for structure determination, and identify tractable material for structure determination where this is not already available.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Daten nicht verfügbar
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
NR4 7UH Norwich
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.