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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-04-30

Antibiotic resistance genes in the environment: a comprehensive, multi-phasic survey of prevalence and transfer

Objetivo



The widespread use of antibiotics has resulted in the rapid dissemination of antibiotic resistance genes amongst bacterial populations. Little is known about the natural reservoir for such resistance genes and how resistance is disseminated in non-clinical environments. The comprehensive survey of the prevalence, distribution, mobility and selection of antibiotic resistance genes within bacterial populations is the major objective of this proposed study. Three antibiotics, gentamicin, streptomycin and tetracycline will be used to select for phenotypic resistance in culturable populations. Published sequence data for resistance genes will be used as a data base for molecular studies to enable the design of probes and primers for PCR screening. The focus of the study will be on discrete genes responsible for antibiotic modification, efflux or ribosome protection. DNA will be extracted directly from all samples using standardized protocols and used for PCR screening to detect the most prevalent genes. Dominant PCR products will be sequenced and sequences compared to the database. This will provide optimized probes and primers for screening the cultured bacteria. In addition, a comprehensive study will be undertaken in the same samples to determine the presence of the actinomycetes responsible for production of the three antibiotics or closely related compounds. Again a phenotypic and genotypic approach will be taken.
The potential for transfer and evidence of mobility will be obtained by exogenous isolation of resistance genes on plasmids or tranposons in marked recipients, obviating the need for culture. The resulting transconjugants will be screened for key genes. Finally each participant will focus on a specific environment to investigate environmental impacts on resistance incidence and study the effects of selection pressure on its prevalence and transfer.
The study will provide a better understanding of prevalence and circulation of key antibiotic resistance genes and their natural reservoirs. This data will be essential for regulating the safe use of antibiotic resistance genes as markers in recombinant organisms released into the environment. In addition to improving our understanding of how resistance genes evolve and understanding the ecology of antibiotic production.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

Datos no disponibles

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

CSC - Cost-sharing contracts

Coordinador

UNIVERSITY OF WARWICK
Aportación de la UE
Sin datos
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

Sin datos

Participantes (5)

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