Objectif
The widespread use of antibiotics has resulted in the rapid dissemination of antibiotic resistance genes amongst bacterial populations. Little is known about the natural reservoir for such resistance genes and how resistance is disseminated in non-clinical environments. The comprehensive survey of the prevalence, distribution, mobility and selection of antibiotic resistance genes within bacterial populations is the major objective of this proposed study. Three antibiotics, gentamicin, streptomycin and tetracycline will be used to select for phenotypic resistance in culturable populations. Published sequence data for resistance genes will be used as a data base for molecular studies to enable the design of probes and primers for PCR screening. The focus of the study will be on discrete genes responsible for antibiotic modification, efflux or ribosome protection. DNA will be extracted directly from all samples using standardized protocols and used for PCR screening to detect the most prevalent genes. Dominant PCR products will be sequenced and sequences compared to the database. This will provide optimized probes and primers for screening the cultured bacteria. In addition, a comprehensive study will be undertaken in the same samples to determine the presence of the actinomycetes responsible for production of the three antibiotics or closely related compounds. Again a phenotypic and genotypic approach will be taken.
The potential for transfer and evidence of mobility will be obtained by exogenous isolation of resistance genes on plasmids or tranposons in marked recipients, obviating the need for culture. The resulting transconjugants will be screened for key genes. Finally each participant will focus on a specific environment to investigate environmental impacts on resistance incidence and study the effects of selection pressure on its prevalence and transfer.
The study will provide a better understanding of prevalence and circulation of key antibiotic resistance genes and their natural reservoirs. This data will be essential for regulating the safe use of antibiotic resistance genes as markers in recombinant organisms released into the environment. In addition to improving our understanding of how resistance genes evolve and understanding the ecology of antibiotic production.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie produit pharmaceutique antibiotique
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments résistance aux antibiotiques
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
COVENTRY
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.