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Inhalt archiviert am 2024-04-30

Antibiotic resistance genes in the environment: a comprehensive, multi-phasic survey of prevalence and transfer

Ziel



The widespread use of antibiotics has resulted in the rapid dissemination of antibiotic resistance genes amongst bacterial populations. Little is known about the natural reservoir for such resistance genes and how resistance is disseminated in non-clinical environments. The comprehensive survey of the prevalence, distribution, mobility and selection of antibiotic resistance genes within bacterial populations is the major objective of this proposed study. Three antibiotics, gentamicin, streptomycin and tetracycline will be used to select for phenotypic resistance in culturable populations. Published sequence data for resistance genes will be used as a data base for molecular studies to enable the design of probes and primers for PCR screening. The focus of the study will be on discrete genes responsible for antibiotic modification, efflux or ribosome protection. DNA will be extracted directly from all samples using standardized protocols and used for PCR screening to detect the most prevalent genes. Dominant PCR products will be sequenced and sequences compared to the database. This will provide optimized probes and primers for screening the cultured bacteria. In addition, a comprehensive study will be undertaken in the same samples to determine the presence of the actinomycetes responsible for production of the three antibiotics or closely related compounds. Again a phenotypic and genotypic approach will be taken.
The potential for transfer and evidence of mobility will be obtained by exogenous isolation of resistance genes on plasmids or tranposons in marked recipients, obviating the need for culture. The resulting transconjugants will be screened for key genes. Finally each participant will focus on a specific environment to investigate environmental impacts on resistance incidence and study the effects of selection pressure on its prevalence and transfer.
The study will provide a better understanding of prevalence and circulation of key antibiotic resistance genes and their natural reservoirs. This data will be essential for regulating the safe use of antibiotic resistance genes as markers in recombinant organisms released into the environment. In addition to improving our understanding of how resistance genes evolve and understanding the ecology of antibiotic production.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

Daten nicht verfügbar

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

CSC - Cost-sharing contracts

Koordinator

UNIVERSITY OF WARWICK
EU-Beitrag
Keine Daten
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten

Beteiligte (5)

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