Obiettivo
The large number of genetically-engineered virus resistant plants which is expected to be put forward for approval for marketing in the EU prompts the need for risk assessment studies on the potential interactions between viral transgene products and infecting viruses or viroids. Major concern centres on three main classes of hazards: heterologous-encapsidation, RNA recombination and synergism which may result in viruses and viroids with altered genetic traits, novel combinations of properties, or novel' diseases. Little information is available concerning the probability of the occurrence of the undesired interactions in transgenic plants, making it impossible to reach generally acceptable conclusions about the environmental safety related to the introduction of these plants. The major bottleneck in obtaining sufficiently large data sets on recombination heterologous encapsidation and synergism is to detect these events.
The current proposal aims to tackle this problem by using a visible reporter, the jellyfish green fluorescent protein (GFP), which will markedly simplify and speed up the detection of the aforesaid events, thus allowing large numbers of virus-infected transgenic plants to be screened. The GFP-encoding gene will be incorporated into the genome of beet western yellows luteovirus (BWYV) and potato leafroll luteovirus (PLRV). The GFP-carrying viruses will then be used to challenge transgenic plants expressing luteoviral and potyviral sequences which are commonly used to achieve pathogen-derived resistance in a large number of important arable and vegetable crops. Luteoviruses are most appropriate for this type of risk assessment studies because (i) they are known to readily undergo heterologous-encapsidation during co-infections in nature, and encapsidate viroid RNA, (ii) their genetic maps suggest that they arose by RNA recombination between different ancestor viruses and several areas on their RNA are potential 'hot spots' for recombination, and (iii) synergism is a common phenomenon in mixed infection of a luteovirus and a potyvirus, leading to enhanced symptom expression and higher virus litres.
A consortium of research partners will combine their complementary expertise in order to address the following objectives:
1. To identify heterologous-encapsidation of PLRV and BWYV in transgenic plants expressing the viral capsid-associated proteins of these viruses, and to assess whether potato spindle tuber viroids (PSTVd) will be encapsidated by these transgenic proteins.
2. To identify RNA recombination between luteovirus-derived transgenes and infecting BvVYV or PLRV, and between PVY-derived transgenes and infecting luteoviruses.
3. To identify the occurrence of synergism between potyviral transgene products involved in virus movement and infecting luteoviruses.
4. To evaluate the probability of the aforementioned events, particularly in relation to naturally occurring mixed infections of the viruses and viroids involved.
The project is organized in work packages in which each of these points will be addressed. The project starts off with generating the required transgenic plants and the full-length infectious luteoviral clones carrying the GFP gene. Measurable deliverables are (i) well described methods to detect possible interactions between viral transgenic products and co-infecting viruses and viroids, and (ii) procedures to assess the probability of these interactions. These methods and procedures are pivotal for regulatory authorities carrying out risk assessment under Community legislation.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche microbiologia virologia
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
- scienze naturali scienze biologiche genetica RNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
- scienze agricole agricoltura, silvicoltura e pesca agricoltura orticoltura coltivazione di ortaggi piante sarchiate
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
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Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
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Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
6700 GW WAGENINGEN
Paesi Bassi
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.