Ziel
Characterization of processes which underlie segregational and structural genetic instability in Bacillus subtilis and decreasing the instability to industrially acceptable levels.
Stable maintenance of foreign genetic information is essential for amelioration of industrially important microorganisms. Small plasmids which replicate as rolling circles are widely used for deoxyribonucleic acid (DNA) cloning in Gram positive bacteria, which is an important class of industrial microorganisms, and their biology is relatively well known. In contrast, large theta-replicating plasmids have only been used recently for cloning in these bacteria and are less well characterised. The well-known small plasmids seem to be intrinsically less stable than the large less-known plasmids. Part of the research during the past year was orientated towards understanding the instability and improving the stability of the small plasmids and the part other towards isolating new and better characterising the known larger plasmids. Bacillus subtilis was used as a model host and processes known to affect stability of genetic information, such as DNA replication of plasmids and phage were studied. Better understanding of the genetic stability is expected to have impact on a number of biotechnology applications.
Significant highlights of the study to date include unexpected activity of the Rep protein of a rolling circle replication (RCR) plasmid was revealed; CHI sequence was shown to be a critical factor in the formation of high molecular weight (HMW) plasmid multimers, which affect the stability of RCR plasmids; phage PBSX lysis gene was identified; replication region of a representative large plasmid was characterised; minus origin of a RCR plasmid was characterised.
The project consists of five main tasks.
Characterization of DNA replication. Three representative replication systems will be studied:
small single stranded DNA plasmids which replicate as rolling circles;
large plasmids which replicate as tereta-forms;
bacteriophage phi29 which replicates as a linear molecule.
Characterization of the role of topoisomerases. Roles of topoisomerase I and DNA gyrase in structural and segregational stability will be determined.
Characterization of the partition systems. Active partition systems will be sought, identified and used to stabilise heterologous replicons.
Construction of post segregational killing systems. These will be based on the repressor and lysis functions of the phage PBSX. Lysis gene will be integrated in the chromosome and the repressor gene will be carried on plasmids, such that the loss of plasmids provokes lysis of the host cell.
Characterization of the stability of genes inserted in the chromosome. The effects of neighbouring structures and functions as well as the chromosomal location will be determined. Segregationally and structurally stable cloning systems should result from these studies.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Mikrobiologie Bakteriologie
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Daten nicht verfügbar
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Daten nicht verfügbar
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Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
78352 Jouy-en-Josas
Frankreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.