Obiettivo
Mapping and sequencing of individual human genes have advanced at a rapid pace. In order to fully understand gene regulation and safely control the expression of important human disease related genes in somatic gene therapy, it is not sufficient to know the regulatory and coding sequences of each gene and of individual factors involved in their expression. It is equally essential to understand the dynamic, three-dimensional nuclear organization and compartmentalization of higher order chromatin structures in relation to other nuclear domains representing the machineries for transcription, splicing, replication and repair. No single laboratory has the intellectual and methodological scope to tackle this problem on its own. In this proposal the expertise required for an interdisciplinary and integrated European effort is brought together by 10 laboratories from 5 European countries.
We will combine multi-colour fluorescence in situ hybridization (FISH) of chromatin structures (from the level of individual chromatin loop domains to the level of entire chromosome territories) together with the immunocytochemical localization of essential protein complexes, as well as in situ assays of nascent RNA synthesis. 3D-analyses will be undertaken at the light microscopic level, including newly developed microscope types with improved resolution and advanced 3D-image analysis procedures. 3D electron microscopic studies will supplement these light microscopic investigations. At the level of entire chromosomes we will perform measurements of the volume, shape and surface of their respective interphase territories and study the 3D-positioning of centromeric and telomeric subregions, as well as of selected individual genes. Model studies of normal human cell nuclei include the overall organization of the active and inactive X-chromosome territories and the three-dimensional topology of the major histocompatibility complex (MHC) in relation to the 3D-distribution of nascent RNA, replication clusters and specific protein domains. For comparison, the 3D-topology of aberrant higher order chromatin structures, such as homogeneously stained regions (HSR) and double minute chromosomes (DMC), will be studied in tumour cell nuclei.
The applicants expect that their combined efforts will (i) establish tools for 3D-gene mapping and 3D-genome analysis and (ii) provide a better understanding of the influence of higher order chromatin structures in situ on gene regulation and function in human normal and tumour cell nuclei. Such an approach will contribute to provide the necessary basis for an understanding of the topology and dynamics of specific, nuclear 3D-structures during development, differentiation and malignancy.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
80333 München
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.