Objetivo
This project is based on the observation that the electrophoresis step in sequencing is a major bottleneck and a considerable financial burden of genome biomedical project. It is aimed at constructing a prototype capillary array sequencer with significantly increased output and decreased operation cost, as compared with slab-gel sequencers. Capillary electrophoresis combines the following advantages as compared with slab-gels:
- Capability of sustaining higher field strengths, leading to shorter separation times
- Easy automation of separation matrix replacement and sample loading
- Miniaturization, allowing a larger number of samples to be studied.
To fully benefit from this potential, however, problems remain to be solved, because capillary electrophoresis is a much more recent technique than slab-gels. In particular, the sequencing experiments performed in capillaries up to now suffered from the short lifetime of gels cast in capillaries, which renders the operating cost prohibitive, from serious band-compression problems, and from detection methods with an insufficient sensitivity/output rate. The team will overcome these limitations, by an integrated interdisciplinary approach combining competences in biology, chemistry, chemical physics and instrumentation.
The project will focus on low operation cost, high automation and robustness for routine operation, and reduce risks by exploring options on a small scale before fixing them for the full-scale prototype. It will include in particular the following innovative approaches:
- - The synthesis of new acrylamido monomers, yielding sieving matrices with longer lifetime and better resistance to hydrolysis
- - "Intelligent" new sieving matrices based on associating polymers, which can be switched from liquidlike behaviour (for automated replacement of used sieving medium) to gellike behaviour (for good separation properties)
- - A new reporter chemistry using lanthanides, for better signal/noise ratio
- - The use of pulsed-field capillary electrophoresis to increase the size range separable at high fields
- - A new technology for mass production of very-low-cost capillary arrays
- - An original detection scheme based on imaging techniques, well adapted to massively parallel acquisition
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias sociales sociología relaciones laborales automatización
- ciencias naturales ciencias físicas física molecular y química
- ciencias naturales ciencias químicas electroquímica electroforesis
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
75005 Paris
Francia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.