Cel
This project is based on the observation that the electrophoresis step in sequencing is a major bottleneck and a considerable financial burden of genome biomedical project. It is aimed at constructing a prototype capillary array sequencer with significantly increased output and decreased operation cost, as compared with slab-gel sequencers. Capillary electrophoresis combines the following advantages as compared with slab-gels:
- Capability of sustaining higher field strengths, leading to shorter separation times
- Easy automation of separation matrix replacement and sample loading
- Miniaturization, allowing a larger number of samples to be studied.
To fully benefit from this potential, however, problems remain to be solved, because capillary electrophoresis is a much more recent technique than slab-gels. In particular, the sequencing experiments performed in capillaries up to now suffered from the short lifetime of gels cast in capillaries, which renders the operating cost prohibitive, from serious band-compression problems, and from detection methods with an insufficient sensitivity/output rate. The team will overcome these limitations, by an integrated interdisciplinary approach combining competences in biology, chemistry, chemical physics and instrumentation.
The project will focus on low operation cost, high automation and robustness for routine operation, and reduce risks by exploring options on a small scale before fixing them for the full-scale prototype. It will include in particular the following innovative approaches:
- - The synthesis of new acrylamido monomers, yielding sieving matrices with longer lifetime and better resistance to hydrolysis
- - "Intelligent" new sieving matrices based on associating polymers, which can be switched from liquidlike behaviour (for automated replacement of used sieving medium) to gellike behaviour (for good separation properties)
- - A new reporter chemistry using lanthanides, for better signal/noise ratio
- - The use of pulsed-field capillary electrophoresis to increase the size range separable at high fields
- - A new technology for mass production of very-low-cost capillary arrays
- - An original detection scheme based on imaging techniques, well adapted to massively parallel acquisition
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki społeczne socjologia stosunki przemysłowe automatyzacja
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne fizyka molekularna i chemiczna
- nauki przyrodnicze nauki chemiczne elektrochemia elektroforeza
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka genom
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
75005 Paris
Francja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.