Objectif
- To prepare replicates of the CEPH bacterial artificial chromosome (BAC) genomic library and send these to partners in Italy, Germany and the United Kingdom.
- To place about 4,000 sequence tagged sites (STS) and other markers on BAC clones of this library.
- To assemble at CEPH a public physical mapping database that contains data concerning these clones featuring the STSs/other markers that they contain.
The overall objective of this project is to provide a mapping resource for constructing sequence-ready physical maps by characterising in the European Union the genomic human BAC library developed at the Fondation Jean Dausset- CEPH. The CEPH BAC library contains approximately 200,000 clones obtained by cloning partial BamHI or HindIII partial digests into BAC vector pBeloBAC. The mean insert size of the BAC clones is 126 kb (15% of clones without inserts not included for the estimate), and the mean genome redundancy is estimated at 7.9. The BAC library will be maintained and managed at CEPH. A copy of the library will be sent to each of the partners for characterisation of clones. Four partners will characterise the library by testing the BAC clones for already known and new STS and hybridization based markers with a total of approximately 4,000 markers/STSs. The partners will coordinate efforts to minimise overlap of STSs used to characterise the BAC library. All data accruing from this project will be deposited in a database that CEPH will make publicly available in a timely fashion. This project will deliver a valuable mapping resource, for positional cloning activities and, especially, for sequencing the human genome.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information bases de données
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
75010 PARIS
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.