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Contenuto archiviato il 2024-04-30

Characterisation and distribution of the CEPH bacterial artificial chromosome (BAC) library, a European resource for preparing sequence-ready physical maps

Obiettivo

- To prepare replicates of the CEPH bacterial artificial chromosome (BAC) genomic library and send these to partners in Italy, Germany and the United Kingdom.
- To place about 4,000 sequence tagged sites (STS) and other markers on BAC clones of this library.
- To assemble at CEPH a public physical mapping database that contains data concerning these clones featuring the STSs/other markers that they contain.

The overall objective of this project is to provide a mapping resource for constructing sequence-ready physical maps by characterising in the European Union the genomic human BAC library developed at the Fondation Jean Dausset- CEPH. The CEPH BAC library contains approximately 200,000 clones obtained by cloning partial BamHI or HindIII partial digests into BAC vector pBeloBAC. The mean insert size of the BAC clones is 126 kb (15% of clones without inserts not included for the estimate), and the mean genome redundancy is estimated at 7.9. The BAC library will be maintained and managed at CEPH. A copy of the library will be sent to each of the partners for characterisation of clones. Four partners will characterise the library by testing the BAC clones for already known and new STS and hybridization based markers with a total of approximately 4,000 markers/STSs. The partners will coordinate efforts to minimise overlap of STSs used to characterise the BAC library. All data accruing from this project will be deposited in a database that CEPH will make publicly available in a timely fashion. This project will deliver a valuable mapping resource, for positional cloning activities and, especially, for sequencing the human genome.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

Dati non disponibili

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

CSC - Cost-sharing contracts

Coordinatore

FONDATION JEAN DAUSSET - CENTRE D'ETUDE DU POLYMORPHISME HUMAIN
Contributo UE
Nessun dato
Indirizzo
Rue Juliette Dodu 27
75010 PARIS
Francia

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Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partecipanti (3)

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