Objetivo
- To develop and improve the prototype exon trapping system.
- To use the improved systems to systematically identify and isolate genes from 2.5Mb of sequenced genomic clones on chromosome 22.
- To extensively evaluate and assess gene identification in sequenced genomic clones using computer based programmes and cDNA selection methods versus our improved exon trapping systems.
Isolation of genes within the human genome is critical to our understanding of the structural, functional and organisational aspects of the genome. Current estimations of the total number of transcribes sequences (genes) in the human genome lie in the order of 75,000. A number of different strategies including genomic sequencing and computer based gene prediction have been employed in an attempt to identify genes in genomic clones in a systematic fashion. However, with the exception of exon trapping, none of these strategies offer a comprehensive method for systematic identification of genes in cloned and sequenced genomic DNA. Consequently, it has been estimated that as many as 10-40% of genes may go undetected.
Exon trapping approaches offer the best potential for systematic gene identification. However, current exon trapping systems suffer from several limitations prohibiting large scale systematic use. The project partners have addressed these limitations and have developed improved prototype systems for exon trapping These systems offer significant advantages over existing exon trapping approaches. The objectives of this project are to develop and improve these systems to allow rapid, efficient and high throughput exon trapping, to apply and evaluate these improved systems for systematic identification of genes in sequenced and cloned genomic DNA. Specifically, the partners will a) improve the prototype exon trapping systems to allow rapid, efficient and high throughput systematic identification of genes in cloned and sequenced genomic DNA, b) use the improved prototypes to systematically identify and isolate genes from 2.5Mb of sequenced genomic clones on chromosome, c) extensively evaluate and assess gene identification in sequenced genomic clones using computer based programmes and cDNA selection methods with exon trapping approaches.
Successful implementation of this project will make a substantial contribution to human genome research since this proposal offers the means to systematically and efficiently identify the large number of genes in genomic DNA that will not be identified by genome sequencing or cDNA selection / sequencing approaches
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
30 Cork
Irlanda
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.