Ziel
- To develop and improve the prototype exon trapping system.
- To use the improved systems to systematically identify and isolate genes from 2.5Mb of sequenced genomic clones on chromosome 22.
- To extensively evaluate and assess gene identification in sequenced genomic clones using computer based programmes and cDNA selection methods versus our improved exon trapping systems.
Isolation of genes within the human genome is critical to our understanding of the structural, functional and organisational aspects of the genome. Current estimations of the total number of transcribes sequences (genes) in the human genome lie in the order of 75,000. A number of different strategies including genomic sequencing and computer based gene prediction have been employed in an attempt to identify genes in genomic clones in a systematic fashion. However, with the exception of exon trapping, none of these strategies offer a comprehensive method for systematic identification of genes in cloned and sequenced genomic DNA. Consequently, it has been estimated that as many as 10-40% of genes may go undetected.
Exon trapping approaches offer the best potential for systematic gene identification. However, current exon trapping systems suffer from several limitations prohibiting large scale systematic use. The project partners have addressed these limitations and have developed improved prototype systems for exon trapping These systems offer significant advantages over existing exon trapping approaches. The objectives of this project are to develop and improve these systems to allow rapid, efficient and high throughput exon trapping, to apply and evaluate these improved systems for systematic identification of genes in sequenced and cloned genomic DNA. Specifically, the partners will a) improve the prototype exon trapping systems to allow rapid, efficient and high throughput systematic identification of genes in cloned and sequenced genomic DNA, b) use the improved prototypes to systematically identify and isolate genes from 2.5Mb of sequenced genomic clones on chromosome, c) extensively evaluate and assess gene identification in sequenced genomic clones using computer based programmes and cDNA selection methods with exon trapping approaches.
Successful implementation of this project will make a substantial contribution to human genome research since this proposal offers the means to systematically and efficiently identify the large number of genes in genomic DNA that will not be identified by genome sequencing or cDNA selection / sequencing approaches
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Chromosom
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Genom
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Daten nicht verfügbar
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
30 Cork
Irland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.