Obiettivo
- To develop and improve the prototype exon trapping system.
- To use the improved systems to systematically identify and isolate genes from 2.5Mb of sequenced genomic clones on chromosome 22.
- To extensively evaluate and assess gene identification in sequenced genomic clones using computer based programmes and cDNA selection methods versus our improved exon trapping systems.
Isolation of genes within the human genome is critical to our understanding of the structural, functional and organisational aspects of the genome. Current estimations of the total number of transcribes sequences (genes) in the human genome lie in the order of 75,000. A number of different strategies including genomic sequencing and computer based gene prediction have been employed in an attempt to identify genes in genomic clones in a systematic fashion. However, with the exception of exon trapping, none of these strategies offer a comprehensive method for systematic identification of genes in cloned and sequenced genomic DNA. Consequently, it has been estimated that as many as 10-40% of genes may go undetected.
Exon trapping approaches offer the best potential for systematic gene identification. However, current exon trapping systems suffer from several limitations prohibiting large scale systematic use. The project partners have addressed these limitations and have developed improved prototype systems for exon trapping These systems offer significant advantages over existing exon trapping approaches. The objectives of this project are to develop and improve these systems to allow rapid, efficient and high throughput exon trapping, to apply and evaluate these improved systems for systematic identification of genes in sequenced and cloned genomic DNA. Specifically, the partners will a) improve the prototype exon trapping systems to allow rapid, efficient and high throughput systematic identification of genes in cloned and sequenced genomic DNA, b) use the improved prototypes to systematically identify and isolate genes from 2.5Mb of sequenced genomic clones on chromosome, c) extensively evaluate and assess gene identification in sequenced genomic clones using computer based programmes and cDNA selection methods with exon trapping approaches.
Successful implementation of this project will make a substantial contribution to human genome research since this proposal offers the means to systematically and efficiently identify the large number of genes in genomic DNA that will not be identified by genome sequencing or cDNA selection / sequencing approaches
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica cromosomi
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
30 Cork
Irlanda
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.