Objectif
- Gain insight into the structure - function relationships in AChE with regard to cholinergic ligands, by combining structural studies on complexes of AChE with representative examples of some important ligand families, with theoretical approaches that would allow relating the structural data to experimentally measured dynamic and thermodynamic properties;
- Other important objectives are the development of improved computer aided design tools for protein - drug interactions.
Results so far
- Crystal structures of 2 complexes of Torpedo californica AChE with Fasciculin, a snake venom toxin, and with a transition state analogue, Huperazine, were solved.
- A Laue diffraction pattern was obtained for an orthorhombic crystal of Torpedo AChE, diffracting out to 2.8Å, in 4 msec.
- Recombinant AChE was expressed in HEK293 cells, and purified. This material will be used in crystallisation trials.
- Automatic procedures were applied to analyse the conformational differences between native Torpedo AChE, and the enzyme structure when complexed to several ligands for which the enzyme-ligand X-ray structure is known. The results suggest that the ligand induced conformational changes are very small and limited primarily to loop regions.
- Multiple copy molecular dynamics' simulations and continuum electrostatic calculations were used to map the entry and exit pathways of small cations, anions, and neutral ligands in the active enzyme gorge. The results suggest that the electrostatic potential varies little throughout the gorge region and is not influenced by the large macrodipole displayed by the enzyme as a whole.
- This project will combine structural studies by X-ray diffraction with theoretical computer simulations and molecular modelling approaches;
- To structure determination of complexes with AChE with ligands of fundamental and toxicological or therapeutic interest by X-ray crystallography;
- Analysis of the electrostatic properties of the enzyme active site and its surrounding using atomic and continuum models;
- Investigation of the effects of thermal motion and electrostatic field on the diffusion of water and ligands in the active site gorge;
- Mapping of binding sites and diffusion pathways of simple ligands in the active site cleft of AChE.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
Ce projet n'a pas encore été classé par EuroSciVoc.
Proposez les domaines scientifiques qui vous semblent les plus pertinents et aidez-nous à améliorer notre service de classification.
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Données non disponibles
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
1050 BRUXELLES
Belgique
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.