Objetivo
Research objectives and content
The aim of the project is to develop a new visualisation tool that allows effective comparative genome sequence analysis. The program will compare multiple sequences from putitatively homologous regions in different species. It shall employ an ACEDB database for storage and retrieval of data. Results from various different existing analysis programs, such as gene prediction, protein homology and regulatory sequence prediction programs shall be visualised and used to find corresponding sequence domains.
The program will function as a stand-alone application and also over the World Wide Web. With this in mind it shall be developed using the Java programming language.
A novel concept of the project is to use available analysis programs relevant to comparative genome sequence analysis, combine the results of these, and graphically present them in an intuitive way, thereby facilitating the analysis of large genomic regions. The availability of this tool will be valuable for comparative genome sequence analysis, and furthermore as an auxillary program to ACEDB it will increase the versatility of this widely used genome database management system. Training content (objective, benefit and expected impact)
The project will provide training in the field of bioinformatics, in particular in analyzing genomic data, and computer programming to create tools for this type of analysis. This is an area of research were there is a great need for people with the appropriate skills, especially in Sweden. This project would provide me with skills and knowledge that would form a basis for a future career in bioinformatics.
Links with industry / industrial relevance (22)
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales informática y ciencias de la información software
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
CB10 1SA SAFFRON WALDEN
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.