Objetivo
Research objectives and content
In this project we propose to study the pH dependent electrostatic contribution to the pH-activity profile of a model enzyme, Fusarium solani pisi cutinase, as well as charge mutants thereof, with the goal of understanding in more detail one of the most important effects contributing to the pH-dependency of enzyme activity. We will use rational Protein Engineering to introduce, remove or move charges that we believe contribute to the pH activity profile. In all three cases we will substitute one residue in the native chain with another, and the residue to be changed will either be the charged residue or the neighboring residue. By modifying the latter we can move the charge without changing the nature of the charged residue. For all mutants we will measure the pH-activity profile using a standard lipolytic assay. We will also investigate the activity changes that accompany the changes in the media composition and correlate the observations to shifts in the electrostatic environment, that will be mapped on the molecular surface each protein (native and mutants). The 3D structures of the mutants will be solved in an X-ray laboratory collaborating with the host institution. ITC measurements will allow us to do thermodynamic studies of cutinase interactions (both native and mutated cutinase) with its substrats and inhibitors. DSC will be used in order to study structural transitions in native and mutated cutinase, as a function of time and temperature, in the absence and presence of substrat and inhibitors. Both measurements will be obtained under different media composition, where the electrostatic properties changed These studies will give us valuable novel insight into protein structure-function relationship.
Training content (objective, benefit and expected impact)
The overall aim of the present project is to develop better models for the description of electrostatic effects on protein activity, namely on the pH-activity profile of the enzyme. This meets the goals of the biotechnological and pharmaceutical science and industry to establish an atomic understanding of protein function. Since cutinase is an enzyme which is secreted by phytopathogenic fungi and bacteria in order to invade and infect plants, we envision that such knowledge could be of direct significance for the design and composition of anti-fungal and bacterial agents, and in a broader sense lead to generic knowledge broadly applicable to a host of relevant protein structure function questions central to the European industry and science.
Links with industry / industrial relevance (22)
Cooperating Partners in Related Projects:
UNILEVER, PHARMACIA, EUROPEAN GENENCOR
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología bacteriología
- ciencias naturales ciencias biológicas microbiología micología
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas enzima
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
9000 Ålborg
Dinamarca
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.