Objectif
Research objectives and content
In this project we propose to study the pH dependent electrostatic contribution to the pH-activity profile of a model enzyme, Fusarium solani pisi cutinase, as well as charge mutants thereof, with the goal of understanding in more detail one of the most important effects contributing to the pH-dependency of enzyme activity. We will use rational Protein Engineering to introduce, remove or move charges that we believe contribute to the pH activity profile. In all three cases we will substitute one residue in the native chain with another, and the residue to be changed will either be the charged residue or the neighboring residue. By modifying the latter we can move the charge without changing the nature of the charged residue. For all mutants we will measure the pH-activity profile using a standard lipolytic assay. We will also investigate the activity changes that accompany the changes in the media composition and correlate the observations to shifts in the electrostatic environment, that will be mapped on the molecular surface each protein (native and mutants). The 3D structures of the mutants will be solved in an X-ray laboratory collaborating with the host institution. ITC measurements will allow us to do thermodynamic studies of cutinase interactions (both native and mutated cutinase) with its substrats and inhibitors. DSC will be used in order to study structural transitions in native and mutated cutinase, as a function of time and temperature, in the absence and presence of substrat and inhibitors. Both measurements will be obtained under different media composition, where the electrostatic properties changed These studies will give us valuable novel insight into protein structure-function relationship.
Training content (objective, benefit and expected impact)
The overall aim of the present project is to develop better models for the description of electrostatic effects on protein activity, namely on the pH-activity profile of the enzyme. This meets the goals of the biotechnological and pharmaceutical science and industry to establish an atomic understanding of protein function. Since cutinase is an enzyme which is secreted by phytopathogenic fungi and bacteria in order to invade and infect plants, we envision that such knowledge could be of direct significance for the design and composition of anti-fungal and bacterial agents, and in a broader sense lead to generic knowledge broadly applicable to a host of relevant protein structure function questions central to the European industry and science.
Links with industry / industrial relevance (22)
Cooperating Partners in Related Projects:
UNILEVER, PHARMACIA, EUROPEAN GENENCOR
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie mycologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines enzyme
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Données non disponibles
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
9000 Ålborg
Danemark
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.