Objetivo
Research objectives and content
This project will make use of the atomic force microscope (AFM) to investigate DNA translocating enzymes using EcoKI type restriction endonuclease as a test system. The translocation properties of these enzymes make them ideal candidates for direct visualisation of protein-DNA interactions. They bind to a specific site, translocation produces large loops and the loops are maintained after cleavage. Furthermore, EcoKI is available in homogenous form in milligram amounts and mutations have been produced which affect different aspects of the cleavage process. Early studies of EcoKI by electron microscopy produced clear pictures of the DNA loops produced by the translocation but the presence of either 1 or 2 DNA loops which could be relaxed or supercoiled, coupled with low resolution and harsh. variable sample preparation methods, precluded the construction of a good model of the translocation process. The higher resolution of the atomic force microscope, improved quality of protein and DNA samples and the ease of simple preparation in conditions which maintain enzyme activity indicate that this is an opportune time to study this translocation process again. It is hoped to follow the translocation process and growth of DNA loops as a function of time and, possibly, visualise the orientation of the protein subunits on the DNA substrate before and during the translocation process. Translocation of DNA by proteins is of fundamental importance in the life of any cell but is with few exceptions not well characterised with respect to mechanism and structure.
Training content (objective, benefit and expected impact)
Training will be given in the molecular biological techniques required for purification of the proteins and DNA substrates and in the use of an atomic force microscope specifically designed for structural analysis of these biological macromolecules. The project will be carried out as a study for the degree of PhD.
Links with industry / industrial relevance (22)
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía electron microscopy
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas enzima
Para utilizar esta función, debe iniciar sesión o registrarse
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
CB2 1TT Cambridge
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.