Cel
Research objectives and content
This project will make use of the atomic force microscope (AFM) to investigate DNA translocating enzymes using EcoKI type restriction endonuclease as a test system. The translocation properties of these enzymes make them ideal candidates for direct visualisation of protein-DNA interactions. They bind to a specific site, translocation produces large loops and the loops are maintained after cleavage. Furthermore, EcoKI is available in homogenous form in milligram amounts and mutations have been produced which affect different aspects of the cleavage process. Early studies of EcoKI by electron microscopy produced clear pictures of the DNA loops produced by the translocation but the presence of either 1 or 2 DNA loops which could be relaxed or supercoiled, coupled with low resolution and harsh. variable sample preparation methods, precluded the construction of a good model of the translocation process. The higher resolution of the atomic force microscope, improved quality of protein and DNA samples and the ease of simple preparation in conditions which maintain enzyme activity indicate that this is an opportune time to study this translocation process again. It is hoped to follow the translocation process and growth of DNA loops as a function of time and, possibly, visualise the orientation of the protein subunits on the DNA substrate before and during the translocation process. Translocation of DNA by proteins is of fundamental importance in the life of any cell but is with few exceptions not well characterised with respect to mechanism and structure.
Training content (objective, benefit and expected impact)
Training will be given in the molecular biological techniques required for purification of the proteins and DNA substrates and in the use of an atomic force microscope specifically designed for structural analysis of these biological macromolecules. The project will be carried out as a study for the degree of PhD.
Links with industry / industrial relevance (22)
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki fizyczne optyka mikroskopia electron microscopy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka mutacja
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka enzymy
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
CB2 1TT Cambridge
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.