Ziel
Research objectives and content
This project will make use of the atomic force microscope (AFM) to investigate DNA translocating enzymes using EcoKI type restriction endonuclease as a test system. The translocation properties of these enzymes make them ideal candidates for direct visualisation of protein-DNA interactions. They bind to a specific site, translocation produces large loops and the loops are maintained after cleavage. Furthermore, EcoKI is available in homogenous form in milligram amounts and mutations have been produced which affect different aspects of the cleavage process. Early studies of EcoKI by electron microscopy produced clear pictures of the DNA loops produced by the translocation but the presence of either 1 or 2 DNA loops which could be relaxed or supercoiled, coupled with low resolution and harsh. variable sample preparation methods, precluded the construction of a good model of the translocation process. The higher resolution of the atomic force microscope, improved quality of protein and DNA samples and the ease of simple preparation in conditions which maintain enzyme activity indicate that this is an opportune time to study this translocation process again. It is hoped to follow the translocation process and growth of DNA loops as a function of time and, possibly, visualise the orientation of the protein subunits on the DNA substrate before and during the translocation process. Translocation of DNA by proteins is of fundamental importance in the life of any cell but is with few exceptions not well characterised with respect to mechanism and structure.
Training content (objective, benefit and expected impact)
Training will be given in the molecular biological techniques required for purification of the proteins and DNA substrates and in the use of an atomic force microscope specifically designed for structural analysis of these biological macromolecules. The project will be carried out as a study for the degree of PhD.
Links with industry / industrial relevance (22)
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften Optik Mikroskopie electron microscopy
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Mutation
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine Enzym
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Daten nicht verfügbar
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
CB2 1TT Cambridge
Vereinigtes Königreich
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.