Objetivo
Research objectives and content
Nucleotide excision repair (NER) is the key pathway for the removal of UV-induced photoproducts and a variety of helix-distorting chemical adducts from DNA in mammalian cells. Nucleotide excision repair (NER) has recently been reconstituted in vitro and the research proposed will attempt to further elucidate the assembly and mechanism of the mammalian core NER reaction up to the excision of a lesion-containing oligomer. The experiments will be performed using defined DNA substrates bearing single lesions and purified proteins. To address where and how NER initiates, the association of damage recognition proteins XPA and RPA with different DNA lesions will examined and the likely resulting DNA structural changes analyzed. The association of transcription-repair factor TFIIH association with the damage recognition complex and subsequent DNA unwinding on both sides of the lesion will be investigated. The requirements for incision by the ERCC1XPF and XPG nucleases 5' and 3' to the lesion, respectively, will be examined and the possible synchronization of DNA unwinding with endonucleolytic incision explored. Finally, in addition to the assembly process, the disassembly of DNA repair complexes following DNA recognition will be a subject of inquiry. With so many factors (30) acting at the same small region of DNA, it is likely that a temporal order of both assembly and disassembly needs to occur.
Training content (objective, benefit and expected impact)
It is expected that the proposed research to be conducted in the Wood laboratory will continue to develop my knowledge and experimental expertise in the fields of nucleic acids enzymology, biochemistry, and molecular biology. Specifically, post-doctoral training utilizing techniques for the study of protein-DNA interaction and DNA structural change will be an important addition to my current experimental abilities. I also hope to further my protein purification skills and the large number of NER factors to be examined should assist that goal. Opportunity to apply techniques for the analysis of protein-protein interactions is also likely.
Links with industry / industrial relevance (22)
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas ácido nucleico
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas genética nucleótido
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Datos no disponibles
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
EN6 3LD Potters Bar
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.