Cel
Research objectives and content
Nucleotide excision repair (NER) is the key pathway for the removal of UV-induced photoproducts and a variety of helix-distorting chemical adducts from DNA in mammalian cells. Nucleotide excision repair (NER) has recently been reconstituted in vitro and the research proposed will attempt to further elucidate the assembly and mechanism of the mammalian core NER reaction up to the excision of a lesion-containing oligomer. The experiments will be performed using defined DNA substrates bearing single lesions and purified proteins. To address where and how NER initiates, the association of damage recognition proteins XPA and RPA with different DNA lesions will examined and the likely resulting DNA structural changes analyzed. The association of transcription-repair factor TFIIH association with the damage recognition complex and subsequent DNA unwinding on both sides of the lesion will be investigated. The requirements for incision by the ERCC1XPF and XPG nucleases 5' and 3' to the lesion, respectively, will be examined and the possible synchronization of DNA unwinding with endonucleolytic incision explored. Finally, in addition to the assembly process, the disassembly of DNA repair complexes following DNA recognition will be a subject of inquiry. With so many factors (30) acting at the same small region of DNA, it is likely that a temporal order of both assembly and disassembly needs to occur.
Training content (objective, benefit and expected impact)
It is expected that the proposed research to be conducted in the Wood laboratory will continue to develop my knowledge and experimental expertise in the fields of nucleic acids enzymology, biochemistry, and molecular biology. Specifically, post-doctoral training utilizing techniques for the study of protein-DNA interaction and DNA structural change will be an important addition to my current experimental abilities. I also hope to further my protein purification skills and the large number of NER factors to be examined should assist that goal. Opportunity to apply techniques for the analysis of protein-protein interactions is also likely.
Links with industry / industrial relevance (22)
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka proteomika
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki kwas nukleinowy
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka DNA
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka nukleotyd
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia molekularna
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Brak dostępnych danych
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Koordynator
EN6 3LD Potters Bar
Zjednoczone Królestwo
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.