Obiettivo
Research objectives and content
Nucleotide excision repair (NER) is the key pathway for the removal of UV-induced photoproducts and a variety of helix-distorting chemical adducts from DNA in mammalian cells. Nucleotide excision repair (NER) has recently been reconstituted in vitro and the research proposed will attempt to further elucidate the assembly and mechanism of the mammalian core NER reaction up to the excision of a lesion-containing oligomer. The experiments will be performed using defined DNA substrates bearing single lesions and purified proteins. To address where and how NER initiates, the association of damage recognition proteins XPA and RPA with different DNA lesions will examined and the likely resulting DNA structural changes analyzed. The association of transcription-repair factor TFIIH association with the damage recognition complex and subsequent DNA unwinding on both sides of the lesion will be investigated. The requirements for incision by the ERCC1XPF and XPG nucleases 5' and 3' to the lesion, respectively, will be examined and the possible synchronization of DNA unwinding with endonucleolytic incision explored. Finally, in addition to the assembly process, the disassembly of DNA repair complexes following DNA recognition will be a subject of inquiry. With so many factors (30) acting at the same small region of DNA, it is likely that a temporal order of both assembly and disassembly needs to occur.
Training content (objective, benefit and expected impact)
It is expected that the proposed research to be conducted in the Wood laboratory will continue to develop my knowledge and experimental expertise in the fields of nucleic acids enzymology, biochemistry, and molecular biology. Specifically, post-doctoral training utilizing techniques for the study of protein-DNA interaction and DNA structural change will be an important addition to my current experimental abilities. I also hope to further my protein purification skills and the large number of NER factors to be examined should assist that goal. Opportunity to apply techniques for the analysis of protein-protein interactions is also likely.
Links with industry / industrial relevance (22)
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole acidi nucleici
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche genetica nucleotidi
- scienze naturali scienze biologiche biologia molecolare
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Dati non disponibili
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
EN6 3LD Potters Bar
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.